三腸蟲頭部有兩個像眼睛一樣的大黑點,這是眼點,功能與人類的眼睛相似,但不能看到個體的影像。三腸蟲的頭部還有一些嗅覺細胞,依靠其對獵物定位。三腸蟲一量聞到食物的氣味,就會向其靠近並悄悄地爬上去。
三腸蟲吃食的方式有點像吸塵器的工作原理:先把進食管插入食物中,消化液就流到食物上,食物開始在三腸蟲體外分解;然後,三腸蟲開始吸取部分消化了的食物;最終,消化作用在三腸蟲體腔內完成,食物通過擴散作用分配到體內的各個細胞。與腔腸動物一樣,三腸蟲的消化系統只有一個開口,不能消化的食物同樣也由進食管排出。
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