issr

ISSR(inter-simple sequence repeat)是Zietkeiwitcz等於1994年發展起來的一種微衛星基礎上的分子標記。其基本原理是:用錨定的微衛星DNA為引物，即在SSR序列的3'端或5'端加上2-4個隨機核苷酸，在PCR反應中，錨定引物可引起特定位點退火，導致與錨定引物互補的間隔不太大的重複序列間DNA片段進行PCR擴增。所擴增的inter SSR區域的多個條帶通過聚丙烯酞胺凝膠電泳得以分辨，擴增譜帶多為顯性表現。

ISSR引物的開發不像SSR引物那樣需測序獲得SSR兩側的單拷貝序列，開發費用降低。與SSR標記相比，ISSR引物可以在不同的物種間通用，不像SSR標記一樣具有較強的種特異性;與RAPD和RFLP相比，ISSR揭示的多態性較高，可獲得幾倍於RAPD的信息量，精確度幾乎可與RFLP相媲美，檢測非常方便，因而是一種非常有發展前途的分子標記。目前，ISSR標記已廣泛套用於植物品種鑑定、遺傳作圖、基因定位、遺傳多樣性、進化及分子生態學研究中。