隨著中國已成為世界貿易組織成員，香港政府認為貨運物流業是香港長遠發展的主要項目之一。此外本行業亦正轉型為提供更全面的物流服務，行業結構更趨專業化。協會為配合發展，於二零零二年四月正式改名為香港貨運物流業協會有限公司，但協會現時的標誌及英名簡稱HAFFA則維持不變。
時至今日，香港貨運物流業協會已擁有數以百計的會員，而且協會更擔當著重要的角色，代表同業向官方及政府各階層表達其立場及意見。同時，香港貨運物流業協會旨在為同業建立共識和準則以及舉辦訓練課程和商務發展計畫，以提高及增強香港貨運物流業的專業水準。
本會使命及職責
港貨運物流業協會的成立目的是推動整個貨運物流業，旨在使同業達至一致的專業水準，以提倡各會員在道德上和在財政上有專業的操守。香港貨運物流業協會一直不遺餘力地在業內的標準貿易條款方面不斷作出更新及改進，另外在信貸申請方面亦不斷引入改良程式以提高財務監管的能力。港貨運物流業協會的成立目的是推動整個貨運及物流業，旨在使同業達至一致的專業水準，以提倡各會員在道德上和在財政上有專業的操守。香港貨運物流業協會一直也不遺餘力地在業內的標準貿易條款方面不斷作出更新及改進，另外在信貸申請方面亦不斷引入改良程式以提高財務監管的能力。
為提高香港運輸及物流業的專業水準，香港貨運物流業協會經常舉辦一系列訓練課程。透過職業訓練局，協會與國泰航空公司或其他航空公司合辦“空運見習員訓練計畫”，為從事空運工作的人事提供“空運貨物基本課程”、“空運單價”、“貨運賠償處理課程”和“危險貨物規例”等訓練課程。於二零零一年，香港貨運物流業協會更聯同教育統籌局、職業訓練局策劃“貨運及物流業技能提升計畫”，以向從事空運業、倉庫業、陸路運輸業、海運業及物流業的在職人員提供業務的基本知識及技術訓練。
此外，協會負責聯絡各政府部門，從而進行商議、決策及提供專業意見等事務。協會同時亦與其他有關的工商業團體，如香港付貨人委員會、貿易通（協會乃其股東之一）、航空公司貨運聯絡小組（CLG）、香港航空公司代表協會（BAR）、香港空運貨站有限公司（HACTL）及亞洲空運中心有限公司（AAT）等保持密切聯繫。協會旨在替會員密切留意與會員最為相關的事項、為會員爭取最有利的權益，例如協會已在貿易通方面為會員爭取到一項特別優惠，讓會員能以優惠的價格使用貿易通電子報關係統的服務。
香港貨運物流業協會亦是國際貨運代理協會聯合會（FIATA）在香港唯一的法定代表，負責監管及協助該會在香港的貨物提單及貨運收據之簽發。
在國際上，協會亦擔當著重要的角色，代表著貨運物流業的聲音，參與亞太航空貨運業協會（FAPAA）、國際航空運輸協會（IATA）及國際貨運代理協會聯合會（FIATA）等國際組織的會議，為香港貨運物流業謀求福利，並確保香港貨運物流業的意見和成就可在同業的國際座談會和研討會上受到關注和認可。
