EVA十三號機設定 與初號機相似，擁有一支長角、4眼的紫色機體。在本作中段完成建造，NERV所擁有的機體。雙座式（Double Entry System），插入栓和プラグソケット各有兩個，由真嗣和薰共同駕駛。胸部內藏有兩隻手臂。
建造方式與其他EVA不同，據說是由使徒直接加裝裝甲板而成但由於新劇場版中adams的數量為四，而初號機亦可能為adams之一，如果以EVA腦後是否出現光環來判定adams的話，初號機-六號機-九號機-十三號機應為adams。
而如果是這樣的話，十三號機明顯與其他三架機體不同
首先，初號機和十三號機在同樣將使徒的s²機關吸收後，初號機並沒有全身呈現使徒的全白色，而是直接打開靈魂之門。
六號機是月面黑色巨人加裝裝甲板而來，而在Q中又發現被十二使徒寄生（一說是由十二使徒改造而來）。
十三號機覺醒成神 九號機被稱為adams的容器，可能是adams的複製體，但其全身都是核心，有可能只是被抽出了靈魂的adams，而其本體有很大幾率被作為了wunder的另一能量源。
其次，十三號機的建造耗費十四年，而且是在一個巨大的容器內建造的，其被取出時，全身裝甲板已固定。不僅如此，在入侵中央教條時，AA彈（anti-atf）對其完全無用。
而且，十三號機吸收十二使徒的核後全身呈現使徒的全白色，肩部拘束器脫落，生長出了白色晶體，在其神化時，這些白色晶體瞬間形成了類翼狀物。
但十三號機已失落，一切都要看向“新世紀福音戰士新劇場版:||”。
覺醒神化 