DDBJ
資料庫簡介：日本DNA資料庫DDBJ(DNA Data Bank of Japan)，於1984年建立，是世界三大DNA 資料庫之一，與NCBI的GenBank，EBI的EMBL資料庫共同組成國際DNA資料庫，每日都 交換更新數據和信息，並主持兩個國際年會－國際DNA資料庫諮詢會議和國際DNA數據 庫協作會議，互相交換信息，因此三個庫的數據實際上是相同的。
DDBJ主要向研究者收集DNA序列信息並賦予其數據存取號，信息來源主要是日本的研究機構，亦接受其他國家呈遞的序列，資料庫通過WWW環球網，匿名FTP，e-mail或Gopher方式為廣大研究人員服務。
他們開發了SQmateh工具，用來搜尋基因或蛋白質中短的鹼基或胺基酸序列區域，並建立了簡便且易操作的SOAP(simple object aeeess protoco1)伺服器。它的數據主要通過Sakura和MST工具來完成。與NCBI,EBM共同構成DNA三大資料庫，這三大數據中心各自收集序列數據，並通過網路每天進行數據交換。近來三大資料庫合作的項目主要包括TPA(tird pannotation)、CON(struct)或CON(tig)和XML數據交換格式的建立。TPA是一種基於已有資料庫中的核酸序列產生的注釋數據，它的格式與傳統的GenBank一樣，只是包含了“TPA”標籤。CON(struct)或CON(tig)用於存儲一些片段的拼接信息，這些片段是序列長度大於350 000 bp的核酸被分割而產生的，但這種長度限制在2004年6月就被取消。
