CDK5最早是從牛腦組織中分離和篩選人細胞周期調節激酶(human cell cycle regulatory kinase)cdc2 相關激酶中得到的。它與cdc2和cdk2同源性分別為58% 和62% 。CDK5包含了全部的保守的蛋白激酶區域,並在第Ⅲ區域中含有cdk家族成員共有的結構域。CDK5蛋白由292個胺基酸殘基組成,相對分子質量為33x103,在不同種屬(人、牛、大鼠、小鼠)之間胺基酸序列同源性達到99% ,表明該蛋白在脊椎動物中是高度保守的。
Ckd5是作為一種多功能激酶,其主要功能是參與神經細胞遷移、軸突導向、突觸發生與傳遞,近年來研究發現,CDK5在多種組織中表達,它可以通過磷酸化不同的調節底物發揮多種生物學作用。