簡述
16S rRNA基因是細菌上編碼rRNA相對應的DNA序列，存在於所有細菌的基因組中。16S rRNA具有高度的保守性和特異性以及該基因序列足夠長（包含約50個功能域）。隨著PCR技術的出現及核酸研究技術的不斷完善，16S rRNA基因檢測技術已成為病原菌檢測和鑑定的一種強有力工具。資料庫的不斷完善，套用該技術可以實現對病原菌進行快速、微量、準確簡便地分類鑑定和檢測。該技術主要有三個步驟：首先是基因組DNA的獲得，其次是16S rRNA基因片段的獲得，最後是進行16S rRNA基因序列的分析。
定義
16S rRNA 即 16S ribosomal RNA，是原核核糖體30S小亞基的組成部分。16S中的"S"是一個沉降係數，亦即反映生物大分子在離心場中向下沉降速度的一個指標，值越高，說明分子越大。
功能
16S rRNA具有多項功能。
1.對於核糖體蛋白的固定起到腳手架的作用。
2.3'末端包含反向的SD序列，用來與mRNA的AUG起始密碼子結合。16S rRNA的3'端與S1、S21的結合被發現與蛋白質合成的開始有關係。
3.與23S進行互動，幫助兩個核糖體子單元的結合。（50S+30S）
4.在A site 穩定密碼子與反密碼子的正確配對。
結構
16S rRNA結構圖