黃夢秋在南匯縣工作期間,積極貫徹中共十一屆三中全會以來以經濟建設為中心的、改革開放的路線、方針、政策、經常深入農村進行調查研究,在推行農村生產承包責任制、 發展鄉鎮工業、加強經濟薄弱地區脫貧工作、廣泛開展“為黨旗增光輝”活動等方面曾做了大量工作。
黃夢秋在1989年經診斷患癌症急需手術後才離開南匯。手術後不久,他又重新走上工作崗位,於1991年被任為上海市級機關黨委副書記,並於該年的冬天,不顧手術後的虛弱,主動請戰,走上太浦河開挖工程的第一線,任分指揮部指揮長。浦東新區建立後,各方面發展很快,為了能做更多的工作,他又數次請戰,於1993年4月,出任中共浦東新區紀律檢查委員會書記、浦東新區監察局局長。
1994年6月6日病故。