主要職責
（一）貫徹執行《水法》、《水土保持法》、《防洪法》、《漁業法》等法律、法規；組織制定水利和漁業產業發展的規劃、計畫，並監督實施；研究制訂水利、水產發展的有關政策；組織制訂市級河道及跨縣（市）流域綜合規劃和有關專業規劃，並監督實施；組織審查各縣（市）流域綜合規劃和有關專業規劃。
（二）統一管理水資源(含空中水、地表水、地下水)、漁業資源及水生生物資源；制訂全市水資源、漁業資源開發、利用、保護配置規劃和全市、跨縣（市）地域水長期供求計畫、水量分配方案，並監督實施；組織有關國民經濟總體規劃、城市規劃及重要建設項目的水資源和防洪的論證工作；實施取水許可證、水土保持合格證和跨縣（市、區）作業的漁業捕撈許可證、水產養殖使用證制度及水資源費、漁業資源增殖保護費徵收制度；發布全市水資源公報；指導全市水文工作。
（三）組織、指導和監督全市節約用水工作；編制節約用水規劃，制訂水資源保護規劃；組織水功能區的劃分和向飲水區等水域排污的控制；監測江河水庫的水量、水質，審定水域納污能力，提出限制排污總量的意見；組織指導漁業水域生態環境的監測和保護工作，並將有關數據和情況通報市環保部門。
（四）組織、指導水行政執法和漁業行政執法；協調並仲裁部門間和縣（市、區）間的水事糾紛和漁事糾紛。
（五）編制、審查市級水利、水電、漁業基建項目建議書，審查縣級水利、水電基建項目建議書和可行性報告；組織水利、水電、漁業科學研究和技術推廣；組織指導水利、水電、漁業基建項目的建設管理；監督實施水利、水電、漁業的法律法規、行業技術質量標準和水利、水電工程的規程、規範；組織指導水利、水電設施、水域及其岸線的管理與保護；組織指導市級河道、水庫、灘涂的綜合治理和開發；管理河道采砂；組織建設和管理具有控制性的或跨縣（市）域的重要水工程；組織指導水利、水電工程的運行管理和安全監管。
（六）組織、協調、監督、指導全市防汛防旱工作和水土保持工作，負責市政府防汛防旱指揮部和市水土保持委員會的日常工作；組織實施市本級、指導全市城市防洪工作。
（七）指導農村水利工作；組織協調農田水利基本建設、農村水電電氣化和鄉鎮供水工作。
（八）負責水利與漁業科技、教育、對外合作工作；指導全市水利、漁業隊伍建設。
（九）制訂水利行業的經濟調節措施；對水利資金的使用進行巨觀調節；指導水利行業的供水、水電、水產養殖等多種經營工作；研究提出有關水利的價格、稅收、信貸、財務等經濟調節意見。
（十）負責漁業行業管理，指導全市水產養殖、捕撈、加工、流通等；組織實施漁業生產經營許可證制度；組織實施水生動物防疫、檢疫工作，負責水產品質量、水產種苗生產的監督管理。
(十一)承辦市政府交辦的其他事項。
內設機構
辦公室組織協調機關日常工作，承辦文秘、檔案、會議、信息、信訪、保密、保衛、宣傳、財務等工作；負責機關及直屬單位的人事、勞動工作；負責局機關離退休人員管理服務工作；研究提出有關水利的價格、稅收、信貸、財務等巨觀調節意見；指導監督直屬單位財務工作；指導水利系統人才規劃、培訓、隊伍建設工作。
規劃與計畫處制定水利發展中長期規劃，會同有關部門制定水中長期供求計畫；編制和審查市內大中河流和重點水利綜合規劃及其他水利專業規劃，協調流域開發工作；承辦水利水電基建審查、審批項目、重點補助項目建議書和可行性研究報告的編制、審查工作；負責涉水工程環境影響評價報告的編制工作；安排全市水利年度投資計畫；對市級水利資金的使用進行巨觀調節；監督全市水利資金的管理和使用；制定水利科學技術發展規劃；承辦水利科學研究和技術推廣工作；承辦水利綜合統計；負責對外合作交流，管理有關學會協會。
建設與管理處組織協調水利水電工程項目建設，負責市級項目初步設計審查、審批和其它項目的審查、報批；組織市級水利工程的建設和驗收；管理水工程建設和安全運行；監督實施水利行業技術質量標準和水利、水電工程的規程、規範；管理水利設計、工程招投標、監理、施工及施工安全、質量監督、工程造價等工作；負責水利設計、監理、施工、諮詢等單位和人員的資質管理；組織對江河、水庫和水利工程的安全管理，農村水電電氣化建設與管理；組織實施市本級、指導全市城市防洪工程建設與管理。
水政與水資源處監督水政監察、水行政執法和水土保持執法工作；承辦縣（市、區）際間的水事、水土流失防治等糾紛調處；參與市際間水事糾紛調處；承辦水利行政訴訟、行政複議、水法規宣傳和普法教育工作；統一管理和保護水資源；擬定管理和保護河道、水庫等水域、岸線、河堤的規章制度並監督實施；組織實施取水許可制度和水資源費徵收管理制度；管理河道采砂，受委託核發河道採礦許可證；發布全市水資源公報；組織水功能區劃分和向飲水區等水域排污的控制；監測江河水庫的水量、水質，審定水域納污能力；提出限制排污總量的意見；指導全市農村水利工作和鄉鎮供水計畫用水、節約用水工作；承擔市水土保持委員會辦公室的工作；指導全市水文工作。
漁業漁政處制定全市漁業發展、漁業資源開發利用和保護規劃、並組織實施；指導全市水產養殖、捕撈、加工、流通等工作；負責全市漁業資源的管理；對漁業捕撈和漁船管理制度、漁業安全生產實施監督、管理；負責漁業資源增殖和水產品質量和水產種苗的監督、管理，負責組織漁業環境監測、保護和水生野生動物保護工作；指導全市漁政執法和水產技術推廣工作，承辦、參與縣際、市際間漁業糾紛調處，承辦漁業行政複議和行政訴訟、漁業法規宣傳等。
直屬單位
麗水水利（一）進行水土保持宣傳教育，普及水土保持知識。（《水土保持法》第九條）
（二）組織編制水土保持規劃。（《水土保持法》第七條）
（三）審批開發建設項目水土保持方案。（《水土保持法》第十九條）
（四）監督檢查開發建設單位防治所造成的水土流失，代無力治理的單位進行治理。（《水土保持法》第二十七條、第三十條）
（五）組織開發建設項目水土保持設施驗收。（《水土保持法》第十四條）
（六）建立水土保持監測網路，對水土流失動態監測預報並公告。（《水土保持法》第二十九條）
（七）查處違反水土保持法律法規的行政案件。（《水土保持法》第三十二條、第三十三條、第三十四條、第三十五條、第三十六條）
（八）負責組織實施生態市建設中相關水土保持工作。
（九）依法徵收水土保持設施防治費和補償費。
水利水電管理站 主要職責
(一) 組織指導全市水庫大壩等水工程的安全監管和水庫除險加固的實施。具體負責全市水利工程的運行管理；負責全市中型水庫和小(一)型病險水庫的年度運用計畫和在建水利工程度汛預案的核准；負責全市中型水庫和小(一)型水庫大壩的安全鑑定；
(二) 組織協調全市農田水利基本建設和農村水利現代化建設，組織擬定全市農村水利的各專項規劃與建設計畫，具體負責編制全市農田水利歲修計畫，組織實施千萬畝十億方節水工程建設和農村節約用水工作；
(三) 水電產業對我市GDP的貢獻率已達8%，已成為我市新的經濟成長點。水利水電管理站負責全市水電產業發展的政策研究，主管全市水電的開發和運行安全管理。具體組織實施全市農村水電電氣化項目和以電代燃料工程項目。
水產技術推廣站
河道管理所
防汛防旱指揮部辦公室
水利水電工程質量監督站
水政漁政監察支隊
南明湖及生態河川管理處
合理保護、開發和利用南明湖及生態河川。
