農村教育研究所把農村基礎教育作為研究重心，把服務於農村基礎教育作為自身的工作宗旨。農村教育研究所的主要任務就是積極打造農村教育研究的平台，研究、服務、引領農村基礎教育，建立農村教育研究交流和溝通的渠道，實現農村教育研究的資源共享。
農村教育研究所自成立以來，相繼對鹽城市10個縣（市、區）的農村教育狀況進行了廣泛的調查和研究，召開了20多場座談會，廣泛聽取了縣（市、區）教育行政部門分管教育教學的領導、教研室有關教研人員、教育規劃辦人員、一些鄉鎮的教育助理和40餘所農村中國小的校長對當前農村基礎教育的意見和要求，發放了5000多份調查問卷，對鹽城市農村基礎教育的情況進行調查，了解了鹽城市農村教育的面上的情況，通過江蘇各大市的教育科研網路，調查了江蘇省農村教育的基本情況，為今後的農村教育研究工作奠定了基礎。
農村教育研究所在廣泛調研的基礎上，總結、歸納出數十個農村教育研究的課題，於各縣（市、區）的農村學校進行合作研究。在學校科技處的支持下，會同市教育局教育科學研究院，確定了三十多個與農村基礎教育改革和發展密切相關的農村教育研究專項課題，並於2007年12月由三家聯合立項。
為總結研究所農村教育研究工作，交流農村教育研究的信息，提升農村教育研究的水平，農村教育研究所編印了《現狀與對策——農村教育調查與研究》專輯，展閱了鹽城師範學院多年來農村教育研究的成果，透視了當前農村教育的現狀，同時還對未來農村教育及其研究進行了展望。此外，農村教育研究所還編輯了《農村教育教學改革研究項目選編》和《農村教育研究課題彙編》兩本特色材料，對校內外農村教育研究工作進行了比較系統的回顧。
