任期間，拒絕地方豪紳的厚禮、請託，不畏橫行鄉里的強暴歹徒，折獄斷刑、賞罰公平，得到兩縣百姓的擁護。後調任南京都察院經歷，又升員外郎，繼升郎中；並出任保定府知府兼密雲兵備副史。高任職期間，盡心盡職，收支清楚。
任知府期間，能使在軍屯中服役的軍士盡職，務農者安心。鏇升都察院右僉督御史，出任延綏巡撫，仍以剛直不阿，執政嚴明，受到朝廷的稱賞。後官到兵部右侍郎，奉敕兼南京都察院副都御史，督師鳳陽。
高身居高位，生活樸素，處事謹慎，淳厚待人，被譽為有"萬石君之風"。明朝末年，因朝政紊亂，高辭官回鄉。1639年（明崇禎十二年）捐資修城。每遇荒年，他總是拿出大批糧食救濟鄉里的百姓。1642年（崇禎十五年）卒，葬於城南花林石馬山之陽。
明崇禎年間兵部侍郎。為官一生清廉，至孝，現嘉祥馬集有其墓地。《神秘的他留人》曾記載：“作為一代文人土司，高光斗是聞名遐邇的。但在田野間，幾百年過後，誰也不會再想起那曾經炙手可熱的人物了。同時，我又感到，時間又會把許多好的東西長久地保留下來，在洞中，高斗光寫下的對聯“誰能超世界，共坐白雲中”的禪意，讓人充滿了無限的想往，引得凡是到過他留山並且有幸一睹的人頓生感慨，對“引真龍到此”的狂草產生了許多想像。”
