第十七任雲貴總督高其卓最早在雲貴實行“改土歸流”，在中甸地區設知縣以下文官和守備、千總、把總等武官；三年，川陝總督岳鍾琪在川康、雲貴一帶實行“改土歸流”；四年，雲貴總督鄂爾泰也在雲貴實施了“改土歸流”。“改土歸流”後，少數民族地區實行與漢族地區一樣的政治制度。丈量土地，徵收稅賦，編查戶籍，組練鄉勇，興教辦學，實行科舉等，從而加強了對邊疆少數民族地區和內地經濟、文化的交流，強化了中央集權對邊疆地區的統治。
其倬遣兵擊破之，擒景明，殲倮、夷數百，疏請於其地駐兵，號普威營。參將駐普洱，守備駐威遠、茶山，改威遠歸流，設同知以下官。土官刁光煥及其孥移置會城，而以新開二鹽井充新設兵餉。設義塾，教夷人子弟。元江府學額外增額二名，待其應試。勸夷人墾田，旱田十年後、水田六年後升科。貴州仲家苗酋阿近及其弟阿臥為亂，其倬使撫定傍近諸苗寨。阿近等失援，遣兵擒戮之，並按治定番、廣順諸苗酋不順命者。疏請改設定廣協，分置營汛，防定番、廣順及西孟、青藤、斷杉樹、長寨、遮貢、羊城?諸地。又移都勻守備駐獨山，改湖廣五開衛為縣，移隸黎平。並言貴州地連川、楚，奸人掠販貧家子女為民害，請飭地方官捕治，歲計人數為課最。貴州民間陋俗，被人劫殺，力不能報，則掠質他家人畜，令轉為報仇；不應則索贖，謂之“拏白放黑”。請加等治罪。土司貧困，田賦令屬苗代納，請清察，責執業者完賦。土司下設權目人等，請令報有司，有罪並懲。詔悉如所請。 三年，進兵部尚書銜，加太子少傅，調福建浙江總督。瀕行，疏言：“鄧川、嵩明、騰越、太和、浪穹諸州縣土軍丁銀，起明嘉靖、萬曆間，遣民防夷，立太和、鳳梧二所，丁徵賦一兩。是於本貫已完民賦，請豁除軍糧。”詔從之。四年，疏言：“福、興、漳、泉、汀五府地狹人稠，無田可耕，民且去而為盜。出海貿易，富者為船主、為商人，貧者為頭舵、為水手，一舟養百人，且得餘利歸贍家屬。曩者設禁例，如慮盜米出洋，則外洋皆產米地；如慮漏訊息，今廣東估舟許出外國，何獨嚴於福建？如慮私販船料，中國船小，外國得之不足資其用。臣愚請弛禁便。”下怡親王會同大學士九卿議行。 五年，台灣水連社番為亂，其倬遣兵討之，擒其渠骨宗等，諸社悉降。尋以李衛為浙江總督，命其倬專督福建。迭疏請整飭鹽政，改造水師戰船，釐定營汛，並下部議行。入覲，加太子太保。上以其倬通堪輿術，命詣福陵相度。其倬還奏：“陵前左畔水法，因溢流更故道，弓抱之勢微覺外張。當順導河流，方為盡善。”下大學士等，如所議修濬。 八年，調江南江西總督。復召至京師，令從怡親王勘定太平峪萬年吉地，進世職三等阿思哈尼哈番。命署雲貴廣西總督。十一年，普洱屬思茅土把總刁國興糾苦蔥蠻及元江夷為亂，攻普洱，通關大寨夷復附苦蔥蠻，渡阿墨河攻他郎。其倬檄提督蔡成貴等分道捕治，擒其酋並所屬五百餘，亂乃定。是歲春，命其倬回兩江總督。秋，命以總督銜領江蘇巡撫。十二年，坐徇知縣趙昆珵償海塘工款，部議降調，即授江蘇巡撫。 乾隆元年，召還京師，復授湖北巡撫，調湖南。討平城步、綏寧二縣瑤亂。三年，擢工部尚書，調戶部。其倬詣京師，過寶應，疾作，卒於舟次，賜祭葬，諡文良。
