氣象歷史
2006年8月31日，一股東風波離開了非洲海岸向西移動，於9月10日進入東太平洋，這一過程中東風波沒有獲得任何發展。特萬特佩克灣以南數百英里外有一片對流區域沿海浪軸線發展出來。系統緩慢向西行進並穩步組織起來。對流和帶狀特徵圍繞著一個正在發展的中心組織起來，系統於9月13日發展成第13-E號熱帶低氣壓。系統接下來繼續組織和強化，於9月14日在距墨西哥海岸約145公里處成為熱帶風暴萊恩。由於風暴上空有發展出反氣旋的潛在可能，並且行進路徑上的水溫較高，美國國家颶風中心通過颶風強度預測模型統計後認為，有46%的可能系統會迅速強化。
風暴的組織性繼續增強，其深層對流發展出中心密集的陰雲，西半部分也出現了定義良好的外流。9月14日晚些時候，風暴接近墨西哥海岸線時開始發展出風眼牆。萊恩在轉朝西北偏北方向移動時繼續加強，並圍繞墨西哥上空的一個中層脊轉動。根據偵察機的報告，美國國家颶風中心於9月15日將位於哈利斯科州卡布科連特斯（CaboCorrientes）西北偏西方向65公里處的萊恩升級為颶風。隨後風暴還在快速加強，六個小時後風速就已經達到每小時165公里，成為薩菲爾-辛普森颶風等級中歸類的第二級颶風。這天晚些時候，風暴寬達16公里的風眼穿越了瑪麗亞群島。9月16日清晨，萊恩在距墨西哥海岸85公里處風速增強到每小時185公里，成為2006年太平洋颶風季的第六個大型颶風。
颶風萊恩還在繼續組織，其風眼已經達到14公里寬，周圍是深度非常大的對流，風暴在9月16日中午達到風速每小時205公里的最高強度。之後風暴意外地轉朝東北方向前進，於UTC16日晚上19點15分在錫那羅亞州一片人煙稀少的區域登入，具體位置在該州埃爾多拉多（ElDorado）東南方向約32公里。這也讓萊恩成為繼2002年的颶風肯納後襲擊墨西哥的最強颶風。墨西哥的山區地區和西南偏西方面逐漸加強的風切變共同作用，令風暴強度急劇削弱，並最終於9月17日消散。萊恩的殘留部分之後進入了美國的德克薩斯州境內。
防災措施
由於萊恩的預計行進路徑接近墨西哥西海岸，阿卡普爾科市相關部門暫時關閉了小型船隻的碼頭。幾個星期前，颶風約翰以一條相似的行進路線經過這一地區，所以一些遊客自願結束了自己的假期搭乘班機回家。許多居民購買了颶風抗災用品準備應對風暴的襲擊。格雷羅州的官員還關閉了該州的學校。墨西哥沿海地區總計有40400名海客被疏散。根據墨西哥內政部長根據該國民防事務運作提供的數據，整個墨西哥有21個州的550萬戶家庭，總計2100萬人受到這場風暴的威脅。政府為此將約2000人疏散到了應急避難場所中。
隨著颶風接近海岸線，從米卻肯州到錫那羅亞州的所有海港均予以關閉，墨西哥國家氣象局向公眾警告風暴將帶來洪水和山崩的威脅。颶風登入時，錫那羅亞州政府宣布自治區阿奧梅、瓜薩維、安戈斯圖拉（Angostura）、薩爾瓦多阿爾瓦拉多（SalvadorAlvarado）、庫利亞坎、納沃拉托、埃羅塔（Elota）、聖伊格納西奧（SanIgnacio）和馬薩特蘭進入緊急狀態。颶風也導致位於該州馬薩特蘭的拉斐爾·博爾納將軍國際機場多架航班被迫取消。
美國國家氣象局在萊恩的殘餘進入美國境內以前就向德克薩斯州大部分地區發布了洪水觀察預警。
衝擊
| 曾登入過的太平洋強烈颶風強度只根據風速衡量 |
| 颶風名稱 | 颶風季 | 登入風速 | 來源 |
未命名
| 1959 | 時速260公里 | |
| 肯納 | 2002 | 時速240公里 | |
| 未命名 | 1957
| 時速235公里 | |
| 伊尼基 | 1992 | 時速235公里 | |
瑪德琳
| 1976 | 時速235公里 | |
| 萊恩 | 2006 | 時速200公里 | |
奧利維亞
| 1967 | 時速200公里 | |
蒂科
| 1983 | 時速200公里 | |
| 基科 | 1989 | 時速190公里 | |
奧利維亞
| 1975 | 時速185公里 | |
| 麗莎 | 1976 | 時速185公里 | |
善後
颶風萊恩登入次日，大部分之前疏散的居民開始返回家中進行清理。一些留在當地的遊客繼續度假，還有一些選擇離開。墨西哥聯邦政府宣布錫那羅亞州的九個自治區進入緊急狀態，受到影響的居民因此可以獲得緊急救災資金的援助。政府還動用了直升機來分發食品並救出被困的居民。政府在馬薩特蘭設立了三個臨時避難所，安置了360人，還在庫利亞坎設立了另外三個避難所，安置了約1000位受到影響的居民。為了防止登革熱的蔓延，政府向67個社區派去了流行病專家，並配有18個移動治療組和15個噴霧防治組。風暴過去一個月後，所有受到影響的道路和高速公路都已經恢復通車。
