公司原名雲南省昭通製藥有限公司，成立於2003年6月12日，2004年7月6日 通過國家食品藥品監督管理局的GMP認證，2005年公司為制定企業長遠發展規劃、打造企業核心競爭力、走品牌發展道路，向國家商標局註冊了“永孜堂”商標，將企業更名為“雲南永孜堂製藥有限公司”，並於2009年10月獲得《雲南省著名商標》稱號 。
公司現有膠囊劑、顆粒劑、片劑三條固體製劑生產線，改擴建二期工程預計2010年1月底完成，並通過GMP認證，屆時將具有年生產15億粒膠囊、15億片、5億袋的生產規模。通過建立公司+麻農、藥農模式，帶動當地製藥產業經濟發展；建立健全製藥產業鏈，實現製藥產業經濟效益最大化；提供400個就業崗位，帶動5萬麻農、藥農致富，有效實現生態平衡及資源保護，達到良好的社會效益。
公司在國家西部大開發戰略和雲南省全力發展生物製藥、打造“雲藥”品牌的戰略指引下，充分利用“植物王國”的生物資源優勢，研製了“天麻醒腦膠囊”、“八味肉桂膠囊”、“利膽止痛膠囊”、“白蔞咳痰喘膠囊”等重點產品。
永孜堂公司經過幾年的快速發展，已擁有多項專利，完整的天麻產品線和系統的創新機制，成長為昭通天麻產業的龍頭企業，並於2008年12月獲得《雲南省農業產業化經營省局重點龍頭企業》稱號。
公司在依靠雲南省政府、昭通市政府的有力支持下，強勁的發展動力，帶動了整個產業結構的最佳化升級和發展方式的快速轉變，使昭通天麻的藥用價值和經濟價值充分體現出來。通過全國市場的運作，永孜堂公司已成功將昭通天麻的資源優勢轉化為經濟優勢和區域競爭優勢，使昭通天麻成功實現了從低端食用產品到高端藥用產品的巨大轉折。
