1990年雙澗鎮被中國基層政權建設研究會授予“全國百顆星”。1992年撤去原李寨鄉、馬窪鄉和雙澗鎮,並為雙澗鎮至今。1993年省民政廳批准為建制鎮(副縣級),1995年被阜陽地區批准為計畫單列鎮,享受縣級經濟管理權。1997年被列為安徽省科教示範鄉鎮。1999年5月被阜陽市列為小城鎮建設明星鎮。1999年12月被省建設廳評為中心鎮。2000年被確定為安徽省195個重點建設中心鎮之一。
2000年以後雙澗鎮人民大都都去江蘇,廣東,與福建省的沿海城市去打工。雙澗鎮大貨車司機比較多據初步估計,如果雙澗鎮的私營大貨車都回去的話雙澗鎮轄區的全部道路都停不下,到廣州,無錫,杭州,溫州,寧波,昆明,瀋陽和烏魯木齊大多數大城市的貨運停車場裡都有來自雙澗鎮的貨運車輛。