個人經歷
他在童年時居於上海，12歲進入慈幼會備修院，1949年中國共產黨上台後，修會失去辦學權，來到香港的華南總修院，隨後往義大利都靈慈幼大學學習並於1961年2月11日於都靈晉鐸。1976年至1978年間於澳門慈幼中學擔任校長；1986年至1989年間在香港仔工業學校任職院長；1996年10月20日獲任命為天主教香港教區助理主教，同年12月8日正式由時任香港主教胡振中樞機祝聖為主教。2002年9月23日，胡振中樞機離世後接任香港主教的職務。
教宗若望保祿二世在2003年表示自己秘密任命了一名樞機，除非教宗已作出了安排，有第三者知道他的身份，否則這位神秘樞機到底是誰將永遠成謎，他的任命將於逝世後變成無效。教宗若望·保祿二世於2005年4月2日去世後，美國和梵蒂岡曾指出李篤安或范忠良可能是神秘樞機，但李篤安本人否認。
2006年2月22日，教宗本篤十六世宣布，委任陳日君為司鐸級樞機，領托爾貝拉馬拉科的瑪利亞贖世主之母堂（Santa Maria Madre del Redentore a Tor Bella Monaca）司鐸銜；3月24日舉行了擢升冊封儀式。
按梵蒂岡規定，陳日君主教可於2007年1月年屆75歲時向教宗申請退休，以盼望退休後能往中國大陸教學。但於同年3月21日，教宗本篤十六世御令陳日君繼續留任主教一職。2009年4月15日，教宗本篤十六世批准陳日君退任香港教區主教。
2013年1月17日，慶祝中華民國與聖座建交70周年，陳日君主教赴台灣輔仁大學演講、訪問。
焦點事件
戴耀廷的主張在政界和傳媒引起廣泛迴響，例如學者趙善軒撰寫“萬人誓詞占領中環”一文，提出五條約誓“天父地母，日月為證，如有違此誓，必遭萬人唾棄。”多個泛民及民間組織已逐步表示支持或作出回應，資深大律師李柱銘表示並願意成為第一被告，而香港教區前主教陳日君樞機亦會有條件支持，但不會參與無了期抗爭
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陳日君