個人資料
揚州大學植保系副教授,碩士生導師。主要從事植物真菌病害研究。
個人經歷
1998.9-2002.6 西南農業大學植物保護系,本科;
2002.9-2007.6 南京農業大學植物病理系,碩博連讀;
2007.8-2010.8 挪威農業和環境研究所(Bioforsk Plantehelse),博士後;
2010.9-2010.11 美國維吉尼亞理工大學生物信息所(VBI),訪問學者;
2010.8-迄今,揚州大學園藝與植物保護學院,教師。
研究方向
1、 植物病原真菌(疫黴菌)與植物互作機制研究
2、 植物病原真菌群體遺傳與抗藥性變異機制研究
研究課題
1、國家自然科學基金《惡疫霉致病性相關RXLR 效應分子的克隆及功能分析》(項目編號31101395),項目主持人
2、江蘇省自然科學基金《辣椒疫霉附著胞階段特異表達基因的篩選和功能分析》(項目編號BK2011443),項目主持人
3、江蘇省高校自然科學研究面上項目《辣椒疫霉RXLR基因的轉錄特徵和功能分析》(項目編號13KJB210009),項目主持人
4、江蘇省屬高校傑出青年教師培育聘請外專項目(項目發文“蘇財教〔2013〕104號”),項目主持人
5、江蘇省普通高校學術學位研究生科研創新計畫項目《辣椒疫霉RXLR基因功能和植物靶標分析》(項目編號KYLX_1354),導師
5、農業部公益性行業科研專項《作物疫病監測防控技術研究與示範》(項目編號201303018)子課題,項目負責人
6、國家桃產業技術體系病害防控崗位科學家(編號CARS-31-2-02),團隊成員
研究論文
目前共發表SCI論文10篇,其中屬於第一作者的為7篇;發表第一作者和通信作者中文核心期刊論文9篇。在NCBI的PubMed欄目中搜尋 “Xiaoren Chen”,或者在中國知網檢索“陳孝仁”獲得詳細信息。
[1] Chen XR, Zhang BY, Xing YP, et al. (2014). Transcriptomic analysis of the phytopathogenic oomycetePhytophthora cactorum provides insights into infection-related effectors. BMC Genomics 15: 980 (SCI).
[2] Chen XR, Xing YP, Li YP, et al. (2013) RNA-Seq reveals infection-related gene expression changes inPhytophthora capsici. PLoS ONE 8(9): e74588 (SCI).
[3] Chen XR, Xing Y, Zhang T, et al. (2012). First report ofPestalotiopsis sydowiana causing leaf necrosis of Myrica rubra inChina. Plant Dis 96(5): 764 (SCI).
[4] Chen XR, Klemsdal SS, Brurberg MB. (2011). Identification and analysis ofPhytophthora cactorum genes up-regulated during cyst germination and strawberry infection. Curr Genet 57(5): 297-315 (SCI).
[5] Chen XR, Cheng BP, Wang XL, et al. (2009) Green fluorescent protein (GFP) as a vital marker for studying the interaction ofPhytophthora sojae and soybean. Chinese Sci Bull 54: 2822-2829 (SCI).
[6] Chen XR, Wang XL, Zhang ZG, et al. (2008) Differences in the induction of the oxidative burst in compatible and incompatible interactions of soybean andPhytophthora sojae. Physiol Mol Plant Pathol 73: 16-24 (SCI).
[7] Chen XR, Shen G, Wang Y, et al. (2007) Identification ofPhytophthora sojae genes upregulated during the early stage of soybean infection. FEMS Microbiol Lett 269:280-288 (SCI).
[8] Kamoun S, Furzer O, Jones JD, et al. (2014) The Top 10 oomycete pathogens in molecular plant pathology. Mol Plant Pathol (In press), doi: 10.1111/mpp.12190 (SCI).
[9] Wang Y, Dou D, Wang X, et al. (2009) The PsCZF1 gene encoding a C2H2 zinc finger protein is required for growth, development and pathogenesis inPhytophthora sojae. Microb Pathog 47: 78-86 (SCI).
[10] Wang Z, Wang Y, Chen X, et al. (2006) Differential screening reveals genes differentially expressed in low- and high-virulence near-isogenicPhytophthora sojae lines. Fungal Genet Biol 43: 826-839 (SCI).
[11] 陳孝仁,邢玉平,李艷朋,徐敬友,童蘊慧. 辣椒疫霉CRN編碼基因的克隆、轉錄特徵及在與寄主互作中的作用. 植物病理學報 (已接受,將發表於2015年第五期)
[12] 鄒金城,邢玉平,孫華偉,李強楷,吳琦,賈祖群,張孝然,徐敬友,童蘊慧, 陳孝仁 *(通訊作者). 辣椒疫霉elicitins基因的克隆及瞬時表達分析. 南京農業大學學報, 37(6): 28-36.
[13] Chen X, Sun Y, Xu J, Ji Z, Chen X, Tong Y. (2013) Pathogenicity analysis of cutinase mutants ofBotrytis cinerea (英文稿). 揚州大學學報(農業與生命科學版), 34(2): 75-81
[14] Chen X, Xing Y, Zhang T, et al. (2012) Identification and characterization ofPestalotiopsis spp. causing leaf necrosis of red bayberry in China(英文稿).植物病理學報, 42 (6): 626-632.
[15] 陳孝仁, 張博月, 邢玉平, 等. (2012) 惡疫霉實時定量RT-PCR分析中內參基因的選擇. 中國農學通報, 28(30): 201-207.
[16] 陳孝仁, 王源超. (2012) 卵菌基因功能分析方法的研究進展. 農業生物技術學報, 20 (5): 568-575.
[17] 陳孝仁, 張博月, May Bente Brurberg. (2012) 利用mRNA差異顯示技術克隆惡疫霉侵染誘導表達的草莓基因. 南京農業大學學報, 35(4):54-58.
[18] 陳孝仁, 王振榮, 徐敬友, 童蘊慧, May bente Brurberg. (2011) 惡疫霉侵染的草莓SSH文庫的構建及分析. 揚州大學學報(農業與生命科學版), 32(4): 64-69.
[19] 陳孝仁, 王源超, 張正光, 鄭小波. (2005) 大豆疫黴菌原生質體製備及再生菌株的生物學性狀. 南京農業大學學報, 28(4): 45-49.
講授課程
植物病理學(生態)、植物病害診斷、植保專業英語(本科生);
真菌學(碩士研究生)
獎勵榮譽
1. 獲得2010年國際卵菌分子遺傳委員會獎學金:Fellowship for Oomycete Bioinformatics and Genetics training(美國NSF, $2,600)
2.獲得2011-2013年度揚州市自然科學優秀學術論文二等獎
3. 2012年揚州大學優秀教學獎(二等獎)
4. 2013年度揚州大學“校園科技先鋒”
5. 2013年本科生畢業設計優秀指導教師
6. 2012、2013年度工作業績考核優秀(校級)
社會工作
期刊Plant Disease、Molecular Biology Reports、《植物病理學報》,審稿專家
國家自然科學青年基金,同行評審專家
江蘇省植物病理學會,理事
中國植物病理學會,會員
國際卵菌分子遺傳學會,會員