歷史沿革
2002年8月26日，成立青木川馬家山自然保護區。
青木川2004年來自中國科學院動物研究所、中國科學院植物研究所、 中國科學院西北植物研究所、西華師範大學、中國科學院西北高原生物研究所、北京師範大學、東北師範大學的專家學者及相關科研人員在陝西省青木川自然保護區開展了生物多樣性考察。
2007年4月申報為國家級自然保護區，更名為青木川自然保護區，並通過了初審。
2009年9月18日批准為“青木川國家級自然保護區”。
地理環境
位置
青木川國家級自然保護區，地處四川、陝西、甘肅三省交界處的秦嶺與岷山交匯地帶，位於寧強縣西部邊陲的青木川鎮境內。北與甘肅武都、康縣接壤，西與四川省青川縣毗鄰，南至青木川鎮南壩村，東至廣坪河，介於東徑105°28′～105°40′，北緯32°50′～32°56′之間。
地質
青木川國家級自然保護區地處秦嶺山地槽褶皺帶南緣，為絹雲母綠泥石鈣石英片岩，構造運動和岩漿活動比較強烈，褶皺緊密，岩層變質，斷層及次級構造充分發育，褶皺以複式批向斜為主，走向呈北東向，主要斷層以北東向為主。
地形地貌
青木川國家級自然保護區屬秦嶺山地，主體是大致東西走向的秦嶺山地槽褶皺帶，山地大部分是海拔1000～1800米的變質雜岩山嶺，西北邊界的主要峰嶺毛家梁、錯歡喜、鳳凰山、馬馬石等均為海拔1700～2000米以上，區內最高海拔鳳凰山為2054米。
土壤
科考研究結果表明，青木川國家級自然保護區內土壤主要為普通黃棕壤和水稻土。
黃棕壤
青木川國家級自然保護區內的黃棕壤屬普通黃棕壤，分布於海拔900～1950米的山坡。地表土壤主要分三層，其中土壤表層（A層）為灰棕色，其厚度受地形、植被覆蓋度的影響而變化較大。澱積層（B層）基本為黃棕色。母質層（C層）一般多為與母岩性質相似的半風化碎屑物質。
水稻土
水稻土是經過長期栽培水稻，土壤在淹水條件下發育而形成的一種特殊的土壤。保護區的水稻土是在黃棕壤基礎上經過人工水耕熟化而形成的銹斑黃泥田土，主要分布在長沙壩和青木川一帶的山間谷地平川。
水文
水系分布
青木川國家級自然保護區的水系呈平行分布，主要有金溪河的支流中梁溝河、平溝河、黃河溝、屠家河和廣坪河的支流後溝河。金溪河發源於區內的中梁埡，向南流至金山寺鄉並在姚灣流入嘉陵江，區內長度18km，流域面積90k㎡，落差為1147m，全部為區內集水。後溝河在保護區內長度約3km，流域面積12km²。青木川保護區境內的河流沒有出現過季節性斷流現象。
水質
通過在該區進行抽樣化驗顯示：水的化學性質屬重碳酸鹽型鈣組Ⅰ、Ⅱ型。pH值在5.9～7.3之間，屬中性水。硬度平均為41.3毫克/升，為軟水。通過對水的化學成分化驗，耗氧量、氮、氨等有機質和酚、氰、砷、汞、氟、鉻等六項化驗均達到一級。
水土流失
由於青木川國家級自然保護區花崗岩、片麻岩等古老岩石分布較大，表層風化、土質鬆散，基岩透水性弱，容易發生土石滑坡和水土流失。保護區水土流失主要集中在靠近南部地區的低山，但水土流失並不嚴重。
氣候
青木川國家級自然保護區所在的寧強縣屬北亞熱帶氣候，具顯著的山地森林小氣候特徵，全年氣候溫涼潮濕，春季雨量較少，夏秋多雨，冬季多雪。當地氣候還具有冬長夏短、春秋相連的特點，海拔越高，此現象越明顯。
區域範圍
青木川國家級自然保護區南北寬15.5公里，東西長28公里，總面積10200公頃，其中核心區面積4058.29公頃，緩衝區面積2634.59公頃，實驗區面積3507.12公頃。
保護目標
陝西青木川國家級自然保護區總體保護目標為：對陝西青木川國家級自然保護區的大熊貓、金絲猴、羚牛及珍稀植物等野生動植物及其棲息地、自然景觀等進行全面保護，增強陝西青木川國家級自然保護區的保護、科研監測和宣教能力，增強資源保護意識，促進大熊貓生態保護網路。
具體規劃設計目標包括：
珍稀瀕危動物保護的典範—構建綜合的動物保護管理體系，全面保護陝西青木川國家級生態系統；
生態修復的示範—恢復保護區生態景觀，重現青木川保護區原生態；
科普教育的基地—體驗自然的捷徑、生態科普的家園，打造自然保護、科普宣教基地。
1.珍稀瀕危動物保護的典範—構建綜合的動物保護管理體系，全面保護陝西青木川國家級生態系統；
2.生態修復的示範—恢復保護區生態景觀，重現青木川保護區原生態；
3.科普教育的基地—體驗自然的捷徑、生態科普的家園，打造自然保護、科普宣教基地。
自然資源
植物資源
植物資源青木川國家級自然保護區內已知有維管束植物1598種，隸屬於173科732屬。 其中蕨類植物27科55屬131種，裸子植物6科16屬28種、被子植物140科661屬1439種。從植物區系的基本組成看，這些植物種類中包含了各種分布類型來源和成分，有溫帶屬種和熱帶屬種，古老的屬種和年輕的屬種，僅分布於秦巴山地的狹域屬種和中國廣布的屬種，和中國特有分布的屬種。地理成分的複雜多樣，極大地豐富了青木川自然保護區植物特種多樣性，也就蘊藏了十分豐富和寶貴的種質資源。
動物資源
動物資源青木川自然保護區的陸生動物區系具有暖溫帶向亞熱帶過渡的區系特徵，動物種類以東洋界種和廣布種占優勢，古北界種類明顯減少，顯示出遷移的地帶區系特徵，是岷山向秦 嶺過渡的涼亞熱帶型自然保護區，據綜合科學考察表明，保護區共有兩棲動物2目8科15種，2目9科15屬18種，其中國家I級重點保護動物1種； 爬行動物2目9科15屬19種；鳥類13目，35科（亞科），134 種，有13種國家重點保護鳥類，其中國家一級重點保護鳥類1種，國家二級重點保護鳥類13種；獸類7目26科56屬70種，其中國家一級重點保護動物5種，國家二級重點保護動物5種。尤以大熊貓、金絲猴、羚牛、獼猴為代表的珍稀物種成為該區域的指示性物種。
開發利用
綜合利用
根據陝西青木川國家級自然保護區實際，邀請專家多次實地調研，提出了建設“明星大鎮、旅遊重鎮、文化名鎮”和“傳奇古鎮、羌人故里、休閒天堂”的旅遊發展定位，編制了《青木川城鎮建設總體規劃》、《青木川旅遊發展總體規劃》、《青木川鎮旅遊區項目修建性詳細規劃》、《青木川文化旅遊古鎮建設規劃》、《金溪新區規劃》、《青木川“一河兩岸”規劃》和《青木川影視文化基地總體規劃》等，城鎮規劃區面積由0.5平方公里擴大到了3.6平方公里。在規劃編制和修編過程中，積極從功能定位、空間布局、產業結構、生產要素和地方優勢等方面總體考慮，對全鎮旅遊資源類型、區域劃分、功能定位、發展目標、旅遊線路等作了分析和規劃，為古鎮旅遊業健康、持續發展提供了客觀的指導依據。
陝西青木川國家級自然保護區按照修舊如舊的原則，恢復了回龍場老街、魏氏宅院、煙館、旱船房、輔仁劇社、關帝廟、輔仁中學等寶貴的明清古建築，建成了景區入口牌樓、金溪河親水景觀、回龍寺等景點，實施了金溪大道綜合配套工程、南壩段綜合配套及青石板鋪設工程、回龍場老街管線地埋工程、回龍橋工程、古鎮河堤防護工程、生態停車場及星級廁所建設等，完成了新街162戶房屋仿古改造工程、集鎮路網改造、濱河路綜合改造及景區綠化工程，高標準建成了金溪新區，規劃了“一河兩岸”工程。
旅遊信息
青木川國家級自然保護區主要遊覽景點：
古棧道遺蹟，金溪河，回龍場，魏氏宅院，唐世盛.輔友社（洋房子），榮盛魁（旱船房），風雨橋（飛鳳橋），輔仁中學，徐家茶館舊址聽徐種德老人講述魏輔堂及青木川王國的興衰，陝西青木川自然保護區，西溝棧道遺址，羌人墓穴——古山，將軍石，玉泉壩的石梯、石門。
青木川國家級自然保護區往北走10公里可到馬家山自然保護區，往西走210公里可到九寨溝。
管理措施
管理機構
陝西青木川國家級自然保護區的管理機構為陝西青木川國家級自然保護區管理局，行政上隸屬於陝西省寧強縣人民政府管理，管理局實行三級管理，即管理局-保護管理站-保護點三級管理體系。管理局內設辦公室、計畫財務科、保護科、科教科、多種經營和社區事務科5個職能科（室），下轄青木川和玉泉壩2個保護管理站以及長沙壩、墳林壩、沙錐梁、麻地溝4個保護點。
管理內容
陝西青木川國家級自然保護區的大熊貓、金絲猴、羚牛及珍稀植物等野生動植物及其棲息地、自然景觀等。
管理方法
貫徹執行有關政策、法規
編制保護區管理計畫
加強保護管理機構能力建設
建立健全規章制度
加強聯防聯管
完善基礎設施建設
建立資源保護網路體系
分區施策
1.貫徹執行有關政策、法規
2.編制保護區管理計畫
3.加強保護管理機構能力建設
4.建立健全規章制度
5.加強聯防聯管
6.完善基礎設施建設
7.建立資源保護網路體系
8.分區施策
