郭瑀(生卒年不詳)，字元瑜，東晉十六國時期敦煌郡人，與敦煌索氏同為本郡大族，祖籍西平郡西都縣。郭瑀少時好學，節操超人。青年時遊學到張掖，拜隱居在張掖東山的著名學者、略陽人郭荷為師，潛心攻讀，精通經義。郭荷死後，郭瑀為師守孝三年，繼承師業，到臨松薤谷(今馬蹄寺)開鑿石窟，設館講學，著書立說，弟子多達千餘人，著有《春秋墨說》、 《孝經綜緯》等。
前涼王張天錫聽說郭踽精通經義，品行高潔，便派使持諭前往臨松山，請郭瑀出山為官。郭瑀婉言謝絕後，繼續過隱居生活。
前秦皇帝苻堅久慕郭瑀大名，也派使請郭瑀出山為官，郭瑀藉口為父守孝，拒絕前往。
東晉太元元年(376年)王穆在酒泉起兵，對抗前秦，派使聯絡郭瑀與敦煌索嘏在張掖起兵策應，封郭瑀為左長史、軍師將軍。後來王穆與索嘏不和，要殺索嘏，郭瑀極力勸阻，王穆不聽，殺了索嘏。郭瑀萬分悲痛，絕食7天而死。
