基本信息
姓 名: 郭寶成
學 科: 魚類進化與基因組學
通訊地址: 北京市朝陽區北辰西路1號院5號
中國科學院動物研究所動物進化與系統學院重點實驗室
個人簡歷
郭寶成,博士,研究員,博士生導師;中國科學院動物研究所魚類進化與基因組學研究組組長。
2010年畢業於中國科學院水生生物研究所,獲水生生物學博士學位。2010-2016年先後在瑞士蘇黎世大學和芬蘭赫爾辛基大學做博士後研究。2016年被授予赫爾辛基大學進化生物學Docent頭銜。2016入選中國科學院率先行動“百人計畫”(青年俊才候選人)。
主要從事魚類分子進化及基因組學研究,在Molecular Biology and Evolution、BMC Biology、Molecular Ecology和BMC Genomic等雜誌上發表了多篇研究論文。
研究領域
生物適應性進化的遺傳基礎是生物學研究的基本問題,了解生物適應性進化的遺傳基礎,對於生物多樣性的保護以及資源的可持續利用至關重要。魚類是所有脊椎動物中進化最成功的水生類群,它們幾乎占領了地球上從海水到淡水所有水域中的生態位,既是生態系統的重要組成部分又是重要的生物資源,同時斑馬魚及刺魚等物種也是生物學研究的模式物種。因此,我們將以魚類為對象,利用分子生物學、遺傳學、基因組學以及生物信息學等方法,在不同尺度揭示生物適應性進化的遺傳基礎以期回答生物學中的基本科學問題。
在未來幾年裡,我們將主要圍繞魚類基因組中重複基因的進化機制和刺魚淡水適應的遺傳機制進行研究。
1. 魚類基因組中重複基因的進化機制及其在魚類分化中的作用
基因(組)重複是普遍存在的生物學現象,是基因組和遺傳系統多樣化的重要推動力量,在生物進化過程中發揮著極其重要的作用。因此,重複基因的功能分化因此一直是研究的熱點。而已有的研究表明,基因(組)重複在魚類適應性進化中起到了關鍵作用。我們前期的研究表明魚類基因組中插入與缺失是重複基因進化的重要動力,因此我們將以此為切入點繼續深入研究插入與缺失在重複基因功能分化中的作用及其在魚類物種分化中可能的作用。
2. 魚淡水適應的遺傳基礎
適應輻射是指由於環境變化而出現生態機遇時,某一生物支系由此快速演變產生多種多樣、各自適應於獨特生態位的物種或者群體的過程;導致不同生態位物種或群體間的趨異進化和相似生態位物種間的趨同進化或群體間的平行進化;是產生生物多樣性的重要方式。儘管自然界中不乏適應輻射的例子,但適應輻射僅發生在某些特定的生物類群中。因為適應輻射的發生,不僅需要生態機遇而且需要相應的遺傳基礎,即生物面對生態機遇時需要迅速地產生可遺傳的表型改變及遺傳創新從而與環境相互作用以利用生態機遇。因此,適應輻射發生的遺傳基礎
一直是進化生物學的熱點研究之一。我們將以發生適應輻射的刺魚類群為對象,運用群體基因組學和比較基因組學的方法,研究全球範圍內刺魚從海水向淡水適應輻射過程中種內平行進化與種間趨同進化的遺傳基礎,從而揭示生物進化的一般規律,即生物進化的可重複性以及可預測性。
科研項目
中國科學院率先行動“百人計畫” 青年俊才候選人啟動經費
代表論著
Guo Baocheng*, Li Z, Merilä J. Population genomic evidence for adaptive differentiation in the Baltic Sea herring. Molecular Ecology, in press.
Guo Baocheng, Lu D, Liao WB*, Merilä J. Genome-wide scan for adaptive differentiation along altitudinal gradient in the Andrew's toad Bufo andrewsi. Molecular Ecology, in press.
Yang J, Guo Baocheng*, Shikano T, Liu X*, Merilä J. (2016) Quantitative trait locus analysis of body shape divergence in nine-spined sticklebacks based on high-density SNP-panel
Guo Baocheng*, DeFaveri J, Sotelo G, Nair A, Merilä J. (2015) Population genomic evidence for adaptive differentiation in Baltic Sea three-spined sticklebacks
Guo Baocheng*, Chain FJ, Bornberg-Bauer E, Leder EH, Merilä J. (2013) Genomic divergence between nine- and three-spined sticklebacks
Guo Baocheng, Zou M, Wagner A*. (2012) Pervasive indels and their evolutionary dynamics after the fish-specific genome duplication
Guo Baocheng, Wagner A, He S*. (2011) Duplicated gene evolution following whole-genome duplication in teleost Fish. In: Felix Friedberg (Ed.)
Guo Baocheng, Zou M, Gan X, He S*. (2010) Genome size evolution in pufferfish: an insight from BAC clone-based Diodon holacanthus genome sequencing
Guo Baocheng, Gan X, He S*. (2010) Hox genes of the Japanese eel Anguilla japonica and Hox cluster evolution in teleosts
Guo Baocheng, Tong C, He S*. (2009) Sox genes evolution in closely related young tetraploid cyprinid fishes and their diploid relative