動物要完成一次穿過海洋或飛越山脈的返巢航行,必須具備很強的導航技能。這不僅要求要朝正確的方向起航,而且要能在氣候多變的條件下保持正確的航向。現在已知動物能夠利用多種導航因子,其中最重要的一個導航因子就是時間。地方時間是隨著動物在地球上的位置而變化的,有時通過地方時間和體內生物鐘時間的比較,動物就能知道自己所處的地理位置。動物在一個地方長期生活後,常能使體內的生物鐘與地方時間同步化,例如一隻長期生活在倫敦的鴿(Columbalivia),一旦被帶往紐約,它體內的生物鐘就會比紐約的地方時間慢5小時,通過兩種時間的比較,鴿就會獲得一種信息,知道自己正處於倫敦以西大約4500公里的地方。如果生物鐘被人為破壞,動物就會出現導航失誤。
動物從太陽和星星能獲得自身位置和地方時間的信息,並利用這種信息導航,但當太陽被雲遮住時,有些動物(如鴿和很多其他鳥類)也不會迷失航向。這些動物的視覺、化學感覺和電磁感覺都與導航和返巢能力有關。蜜蜂可以根據太陽的位置確定返巢方向,當太陽被雲霧遮住時則靠偏振光導航。鮭魚靠味覺能辨別出出生和生活過的河流。它們在海洋中發育成熟後總是回到這條河流產卵。還有很多動物在離巢較近時,是通過視覺,依據巢周圍的地形地物(即景觀)來確定巢的具體位置的。例如在沙蜂(Philanthustriangulum)的洞口周圍放上一圈松塔,待沙蜂習慣了這種安排後,再把這圈松塔移到幾米以外,結果發現沙蜂覓食回來後不是飛向自己的洞口,而是飛到了這圈松塔的中央位置。可見它是根據洞口周圍的景觀來判斷洞口位置的。
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