簡介
祝由科作為一種官方化的巫醫，自隋代開始被納入官方醫學範疇，唐承隋制，在醫署設立“咒禁科”主管禁咒，除邪魅之法。
據《中國歷代官制詞典·太醫院》條太醫院所定的十三科，元代為：大方脈科、雜醫科、小方脈科、風科、產科、眼科、口齒科、咽喉科、正骨科、金瘡腫科、針灸科、祝由科、禁科；明代為大方脈、小方脈、婦科、瘡瘍、針灸、眼、口齒、接骨、傷寒、咽喉、金鏃、按摩、祝由。
祝由科的官制地位雖被傳統觀念的醫家不齒，但還是在唐至明所屬太醫局（院）留有一席之地，清人入關以後，秉承了明朝官制，雖太醫院已經廢除祝由科一職，但滿族信仰薩瑪教，對患病者除正規醫藥外，尚保留“跳神”習俗，以為驅役鬼神。
軒轅碑記醫學祝由十三科《雞林·舊聞錄》：“薩瑪教為東夷一種宗教，在昔滿洲人亦迷信之。此教今日在宋、黑、馬三江下游，南及朝鮮，鹹鏡諸道皆染此習。凡人患病輒延男巫，亦有女覡至家，……蹈足而行，作咒如魅言及人術，以除患疾。”可見皇室在愚民政策上有所變動，其實是換湯不換藥罷了。
然而祝由科雖在官方醫科中有一席之地，其自身並無十三科之分，為何民間祝由科有十三科呢，又為一些名醫所借鑑呢？
究其原因：一是“祝由一術統攝內外諸症，不用方脈，可免誤辯溫涼；不用針灸，可免誤刺穴道；不用方藥，可免誤下毒藥。民間傳訛，誤為官家分類，以一科而分十三科之屬爾。”二是“治病之法，深奧千里，淺學濟急，未辨精微，頗多誤事。鄉民鄙人，倉猝之間，勿藥而喜，類泛簡便，得一二者，救活生靈，善功德事哉！”
十三科主治
祝由各科治療方法主要據道教靈寶派典籍宋末元初·林靈真編輯的《靈寶領教濟度全書》內（存思玄妙品·咒）和（符簡執范品·符）及通行本所載的為主，其十三科之主治分類為：
大方脈科（主治：傷寒、痰喘，一切內症兼雜醫）
諸風科（主治：麻木、癱瘓及一切中風）
胎產科（主治：胎前、產後及婦科諸症）
眼目科（主治：眼病及時疫眼病）
小兒科（主治：小兒驚、疳等諸症）
口齒科（主治：牙痛、骨鯁及喉科諸症）
內外科（主治：療毒、淋濁、痔瘡及一切惡候）
傷折科（主治：跌打壓傷及諸蟲獸傷）
耳鼻科（主治：耳聾、鼻衄及一切耳鼻病）
瘡腫科（主治：惡瘡、癩疥、無名腫毒等）
金鏃科（主治：金屬所傷及消針化刺）
書禁科（主治：鎮邪、驅鬼、辟毒、截症）
砭針科（主治：癲癇，筋骨疼痛）
傳統醫學
祝由治病是傳統醫學的組成部分，早在《黃帝內經》中就有祝由十三科的治病方法。由於歷史的原因，祝由治病一直只在民間秘密流傳，被極少數人掌握套用。
祝由有一種信息物質的存在，有穿透性。祝由各有門派，一般都是咒語，古言符號，真言同用，符是符號語言，咒是語言符號，互依互存，相得益彰。
祝由的特性和功效是多方面的，利用祝由可傳遞、接收、凝集、儲存宇宙信息為自身和他人治病。治病簡單，方便，快速，不消耗自身精氣，以發揮宇宙信息應有的能量，對治療疑難怪病有不可思議的功效。
祝由治病現在還無法用現代科學理論加以解釋，但療效卻不可思議，看似簡單，實則深奧，看似神秘，實則科學，有待炎黃子孫發掘、繼承、套用和推廣。
《軒轅碑記醫學祝由十三科》 二卷、增補一卷 清涵谷山人撰 西蜀青城山空青洞天藏板刊本
空青洞天乃是西蜀清代道教刻書的中心，由道觀專職人員收集、整理少見稀有的道書。除此書外還有《呂祖全書》、《三峰全書》等等，用紙講究，用墨精到，刻印雙美，校對細緻，在清代就是修行學道者尋求的書籍。
此套書，兩卷及補編全，分為四冊，與其它坊刻本的《祝由科》相比較，書品、版刻、用紙、用墨、印刷都算精緻的。
全書白色棉紙，光滑、平整、簾文細密，因為套有紅色印刷，經百餘年暈化，使之紙張自然舊中略現紅色。
朱墨套印的書，製版困難，印刷複雜，歷來是藏書家爭相搶購的版本。唯一遺憾的是，古代的紅色屬於礦物原料，和墨相比，膠性不夠，故而不能見水，潮濕，會使紅印的部分顏色暈化、變暗，甚至有完全脫色的現象。這套書的紅印部分，萬幸沒有暈化，但已經顏色稍淡、淺，或者已經由朱紅轉為曙紅色，但仍然清晰可辯，紅黑分明。
