如今西沙群島的第一大島永興島上尚存一間磚瓦廟，中國漁民們稱為“貓注娘娘廟”，它也是西沙群島最大的媽祖廟。永興島，當地漁民稱“貓注”，據考是“錨嶼”的諧音；娘娘，即天妃娘娘，漁民們也稱為“貓注娘娘”，該稱呼應源於明代。據記載娘娘廟原先有“海不揚波”匾額，另有一副楹聯曰：“兄弟感靈應，孤魂得恩深”。因在西沙群島漁民中流傳有108位結義兄弟死後成為孤魂的傳說，故“感靈應”、“得恩深”指的就是這些遇難兄弟得受海神天妃靈應，並得沐天妃恩惠，他們才從此成為海洋群神並共享天妃香火。迨至1932年，永興島被法國人非法占據，他們竟把中國漁民建造的貓注娘娘廟，妄改為“黃沙寺”，並更換廟門對聯，企圖製造偽證以說明越南皇帝於1835年派人在島上建寺的說法。不想他們卻在對聯末尾的“大南皇帝保大十四年三月初一”落款上露了餡，因為“保大十四年”是公元1939年，由是謊言不攻自破。
在西沙群島媽祖信仰遺蹟其實還很多。如在貓注漁民中還流傳有一首媽祖及陪神詩咒，據說當在海上遇險之際，念誦此詩，媽祖諸神則會顯靈救助。此詩咒曰：“策賜山峰布斗，明芝興德顯神。順贊天后聖母元君、左千里眼神將、右順風耳守海將軍、掌倉庫天仙大王、貓注娘娘、馬伏波爺爺、一百零八兄弟公、男女五姓孤魂，保佑平安。”詩咒中稱天后聖母，當產生於清代。其中“山峰布斗”當即“大風普度”，“明芝”應即“明著”，為天妃封號之一。
在這些島上，亦尚存一些媽祖文物。如在上世紀20年代，海南瓊海漁民從西沙珊瑚島海里撈起一尊媽祖石雕像，它是古代中國遇難沉船上的遺物。後來越南人曾冒認為古占婆人石雕，但仍從中國漁民稱為“娘娘”。直到日本投降後，中國漁民始為蓋娘娘廟供奉。又如在西沙群島的琛航島西北角有娘娘廟，該廟有一件明代龍泉窯的瓷觀音，明代漁民認為是媽祖娘娘的化身，故被供奉至今已數百年。
西沙、南沙群島除稱媽祖為娘娘外，也稱之為“天后婆”或冠以地名的某地婆。如巴島（永興島）的天后婆稱巴婆，葡萄牙文正是根據該稱呼把永興島譯為Papo島；又如三腳島（今琛航島）的天后婆，稱三腳婆，意即三腳島的天后婆。這與台灣的湄洲媽、泉州媽、銀同媽之類命名相似。
據調查，在西沙、南沙群島的甘泉島、北島、東島、黃山馬（今平島）、太平島，都有規模不一的娘娘小廟。如西沙第二大島東島的娘娘廟20世紀70年代尚存，並有海南漁民莫經琳題刻對聯：“前向雙帆孤魂廟，后座一井兄弟安”。目前在西沙和南沙群島上尚存明、清二代遺留下來的小廟20多座，這些廟除了娘娘廟外，還有土地廟、神廟、兄弟公廟等。這些神廟有些是中國漁民歷盡艱辛從大陸運載磚瓦到島上建造的，更多的小廟是就地取材、用島上珊瑚石壘成的。它們規模雖然都不大，但充分說明南海漁民們對媽祖等海神的篤信之情，也說明這些南海島嶼自古就是由中國人經營和開發的。
