醫院在毛寬榮院長的帶領下，擁有李懷寶、職利琴、司克、陳文平、李朝陽、馮海龍、沈雲天等一大批肛腸屆老專家和中青年手術骨幹，技術力量雄厚，專科特色明鮮。醫院主要診治範圍為痔瘡、肛裂、肛瘺、肛周膿腫、肛乳頭肥大、肛門畸形、直腸脫垂、結、直腸癌、便秘、結腸炎等，還開展內、外、婦、兒、針灸、推拿、治未病等常見病的診治。同時開展PPH手術、腹腔鏡下直腸癌低位保肛切除術、電子腸鏡下各種治療術、小兒先天性肛門畸形、便秘外科手術等，目前是西北地區規模較大的肛腸專科醫院。
醫院二十多年來始終以“中西結合，以現代科技興院辦醫;誠實可信，為患者解決實際問題”為醫院宗旨，大力推廣各種公益活動，繼承中醫診治傳統，藉助西醫創新的科技，形成中西醫結合標本兼治、微創無痛治癒肛腸病的治療特色，切實為前來求診的肛腸病患者能解決病痛實際問題。
西安馬應龍肛腸醫院現設定床位300張。現有員工240人，環境舒適，設施齊全。是陝西省醫保、陝西省新農合、西安市醫保、西安市新農合、西安市居民醫保定點醫院，泰康人壽等商業保險定點醫院，也是省內各地市和青海、新疆城鎮職工、城鎮居民異地就醫結算定點醫院，同時，也是省市農合、醫保報銷直通車醫院，患者出院時即可在院內直接報銷。
