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戰爭爆發
這場戰爭歷時三年,起始於22BBY(BBY是Before the Battle of Yavin的縮寫,時間單位,比如雅汶戰役前32年記作32 BBY)的吉奧諾西斯戰役。銀河共和國末期,由於政府腐敗無能,眾多星系開始有組織地脫離共和國,成立獨立星系邦聯。面對越來越緊張的形勢,共和國動用了一支龐大的複製人軍隊,在吉奧諾西斯星球先發制人地對分離主義軍隊實施軍事打擊。這次戰役共和國獲勝。
混亂的三年
吉奧諾西斯戰役之後的三年內,戰火燃遍銀河系的各個角落。絕地武士紛紛被授予將軍之職,領導共和國軍隊在各地的軍事行動。最高議長帕爾帕庭被授予更大的權力,並成為共和國大軍的最高統帥。

尾聲
這場星際戰爭結束於19BBY。這一年中,分離主義軍隊先後失去了政治領袖杜庫伯爵,和軍事領袖格里弗斯將軍,雖然各地的駐軍發動了一些大規模進攻,但是這些攻勢大多在複製人軍隊的反擊下漸漸瓦解。
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由於共和國在這次戰爭中使用了大量複製人士兵,且贏得了最終勝利,故這次大規模星際戰爭被稱為“複製人戰爭”。