主要職能
一 科教基金管理 承擔衛生部委託的“衛生部科研基金”和“青年人才基金”的科研基金管理及協助參與國家級有關課題的管理。負責由社會相關單位出資設立、用於醫學研究和衛生技術人員培訓及社會公益性事業的專項基金管理。迄今為止，與部分國內外知名企業聯合設立了中藥注射液、關節炎防治教育、肝炎防治與健康教育、高血壓防治教育、西部衛生骨幹人才培養計畫等專項基金， 目前這些基金運行良好。
二 成果轉化與推廣 負責組織實施衛生部高新技術推廣計畫。主要對重大疾病或重大公共衛生問題有較好解決作用的新技術推廣套用於醫學領域。範圍主要包括新的藥品、生物製品、診斷試劑，新醫療器械、新材料、新治療方法等。經過審核批准的項目，向項目持有單位頒發“衛生部高新技術推廣計畫項目證書”。針對社會需求和技術產品特點，有選擇的進行市場推廣,為科研單位與企業搭建交流與合作的平台。如舉辦的“第五屆中國北京科技產業博覽會（國際周）醫藥科技項目推廣洽談會”，協助衛生部開展的醫藥衛生十年百項推廣計畫等都收到了較好的結果。
三 衛生技術評估 協助政府進行衛生技術準入工作，對現有及引進的衛生技術進行評估；對國際衛生技術評估結果進行傳播。為政府、國內外機構和企業提供評估、諮詢、培訓、調查等服務。與相關機構開展評估合作，接受委託與科技評估有關的任務。具體服務內容：1）巨觀科技評估：計畫、政策、機構、效果；2）醫藥衛生技術發展預測評價；3）醫藥衛生科技項目評估：立項、驗收、可行性；4）科技評估培訓：指標、方法、質量、管理規範培訓；5）醫藥衛生技術項目委託：評估、調查、諮詢、管理。
四 衛生技術培訓 根據在職繼續醫學教育需求，組織舉辦各種高級培訓班、研討會、學術交流會及網路教育等，有針對性地開展衛生技術人員培訓工作。
五 臨床研究與協作 對上市前後的藥品、保健品、醫療器械等做進一步的研究與觀察，探討其作用特點及不良反應，組織全國範圍的臨床協作。
六 科技政策諮詢及中介服務依託衛生行業的相關科研院所、協會、各專業技術工作委員會和與之緊密聯繫的專家群，向醫療衛生部門和醫藥企業提供政策和信息諮詢、科技項目包裝策劃、市場調研和預測、技術服務、醫藥產品註冊申報諮詢等服務。近年來，中心先後為國外企業代理了進口保健品和醫療器械等的註冊工作。 作為衛生部管理的全國醫藥衛生科研和教育工作的助手和支撐機構，中心工作是衛生部工作的延伸,是各級政府和醫藥衛生行業單位之間的橋樑和紐帶。中心將熱忱為政府服務、為研究院所、醫療單位和企業服務。我們願意與各界人士精誠合作，共同發展。
