蛋白質意義
幾乎所有的蛋白質合成都起始於N-端，蛋白質N-端的序列組成對於蛋白質整體的生物學功能有著巨大的影響力。例如N-端序列影響蛋白質的半衰期，同時關聯著蛋白亞細胞器定位等，這些與蛋白的功能和穩定性息息相關，對蛋白進行N-端測序分析，有利於幫助分析蛋白質的高級結構，揭示蛋白質的生物學功能。
序列的方法
目前對蛋白N端測序主要分類兩大類，其一為非質譜技術，例如經典的Edman降解法、利用反轉錄RT-PCR得到對應蛋白的cDNA，再來反推得到蛋白序列；其二為質譜技術。各自都有其使用的長處和制約之處，目前，市面上採用的，依然是基於經典的Edman降解法原理，利用美國ABI公司Procise491蛋白序列測序系統進行蛋白N-端測序。
測序的原理
蛋白質和多肽N-端測序技術是以Edman化學降解法為基礎的，Edman化學降解，其基本原理是包括通過異硫氰酸苯脂與蛋白質和多肽的N-端殘基的偶聯，苯氨基硫甲醯酞（PTC-肽）環化裂解，和噻唑呤酮苯氨（ATZ）轉化為苯異硫尿胺基酸（PTH-胺基酸）三個主要的化學步驟，每個循環從蛋白質與多肽裂解一個胺基酸殘基，同時暴露出新的游離的胺基酸進行下一個Edman降解，最後通過轉移的PTH-胺基酸鑑定實現蛋白質序列的測定。
