基本信息
製作陣容：該片由曾經製作過《機動戰艦Nadesico》和《D.N.Angel》的XEBEC公司及ProductionI.G.共同製作，人設是《高達SEED》的平井久司，監督是曾執導《D.N.ANGEL》的羽原信義。
原作：ＸＥＢＥＣ
企畫：大月狻倫下地誌直
文芸統括：沖方丁
シリーズ構成：山野辺一記
キャラクターデザイン：平井久司
メカ?プロップデザイン：鷲尾直広
色彩設定：関本美津子
音響監督：三間雅文
美術監督：小山俊久
攝影監督：広瀬勝利
３Ｄ監督：本間潤樹
モニター設計：中野剛
音樂：斉藤恆芳
プロデューサー：中西豪 千野孝敏 能戸隆
助監督：山岡信一
監督：羽原信義
生死有無
理解的價值
是同化一切
融入輪迴
還是面對著你
確定我的存在
比記憶更真實的
是存於內心的感動
比世界還寬廣的
是那永不忘懷的家園
所以，你在那裡嗎？
我就在這裡
在這裡，等你回來
等一片碧海藍天，重新來過
劇情簡介
29年前，人類受到了可讀取思維的未知生物“Festum”的襲擊，陷入了巨大的危機中。面臨存亡關鍵時刻的人類啟動了“樂園計畫”，利用捕獲的Festum的Mir為能量，建造起大型可移動和偽裝的戰鬥生活兩用基地，並模仿Festum製造了可讀取Festum思維的中央電腦“所羅門”，和可對抗Festum的巨大機器人FAFNER。然而，在“Festum”壓倒性的優勢力量之下，整個日本毀於一旦，僅有參與了原計畫的人得以倖存，繼續著同Festum的艱苦鬥爭。
當初日本被襲擊時，Festum奪取了所有日本人的生育能力，所以為了使Fafner能有合適的駕駛員，樂園計畫還包括了利用人工技術繁殖後代，並在孩子們身上試驗性注射Festum因子等幾項內容。實驗充滿了危險與高昂的生命代價，第一代繁殖出來的孩子因為各種原因幾乎夭折殆盡，僅有三個孩子活了下來；而世界上另外一個反抗Festum的組織“新國聯”始終對龍宮島有敵意，並接受了不少島上的叛逃者。儘管在這樣惡劣的條件下，龍宮島試驗製造的第二代孩子仍然在成功的偽裝以及成年人的照顧之下成長起來。儘管此時人類仍處於Festum的威脅下，且真正的家園早已被毀滅，但對於外界情況的一無所知，還是是孩子們得以享受幸福的童年——和普通的孩子一樣每天上學，開心的玩耍嬉戲……
然而完全隔絕於世的樂園，始終是不存在的吧。因為一次偶然的機會，少年皆城總士在修理一台舊收音機時意外的將島外的Festum召喚進來，險些被其所同化，幸好關鍵時刻好友一騎將他的眼睛劃傷讓他恢復了本性，從此，總士和島上的成年人一樣也知道了外界的真相……
歲月流逝，總士和島上的孩子們在一天天的長大，也在一天一天的走向世界的真相。一次總士奉命出島剛剛回來，不料Festum也隨之而來，龍宮島一改往日恬靜的生活景象，轉眼變成了一座海上戰鬥堡壘。大人們開始操縱所羅門電腦指揮戰鬥，總士進入了Siegfried系統，一騎也因適應值最高而不得不駕駛Fafner出戰。從此，命運的齒輪開始了鏗鏘的轉動，生命的指針開始飛速的旋轉……
戰鬥日益白熱化，隨著Festum的不斷來襲，島上所有適應值合格的孩子們都開始了戰鬥訓練，不僅是初次參加戰鬥的一騎和總士，還有想為在同Festum的戰鬥中身亡的爸爸媽媽報酬的關良、一心追隨關良並想證明自己比一騎強的劍司、平時膽小但戰鬥勇猛的衛、為人文和善良的甲洋，甚至連身患頑疾的翔子也難逃戰鬥的厄運。然而戰場畢竟是戰場，對於尚未成年的他們來說，死亡與毀滅並非遙不可及，而是真真切切的伴隨著每時每刻的陰影。有的人因死亡而得到解脫，但活下來的人們卻不得不飽受現實的折磨——翔子戰死，甲洋被同化，龍宮島被新國聯發現，加上總士那越來越執著於戰鬥，對其他人愈發冷酷無情的作為，使裂痕在曾經親密無間的夥伴中產生、蔓延……也使曾經堅定的心漸漸開始迷茫，並最終導致了一騎因無法理解總士而隨新國聯的間諜逃出了島……
以為終於能用自己的雙眼看到外界的一騎，再見到以前離島的道生等人，並了解到自己母親死亡的真相後，卻發現自己一直以來根本沒有能體會到總士的痛苦——外面的世界各處都充滿了戰爭，所崇敬的城市和生活不過只是一廂情願，原來只有龍宮島才是人類惟一的樂園。也直到此時，曾受困於到底是朋友重要還是Fafner重要之類問題中的一騎，才開始理解到總士多一直戰鬥的信念——無論付出怎樣的代價，都一定要保護龍宮島……
而另一方面，在孩子們漸漸改變的同時，龍宮島也發生了巨大的變化——龍宮島的Mir之核覺醒了。其實這個核就是總士的妹妹皆城乙姬，當年總士的母親在懷乙姬時，曾被島上正在研究中的Festum的Mir襲擊，成為了半同化狀態，且隨著她漸漸的被完全同化，她最後的願望就是將已是胎兒的乙姬放入人工子宮養大，而取出的乙姬卻變成了Mir之核。與此同時，那天與暴走的龍宮島Mir產生共鳴的北極Mir（北極的Mir是人類最大的威脅），也派出了Festum襲擊龍宮島，並在交戰中同化了一起的母親紅音……
儘管龍宮島的Mir最終安靜了下來，但成為了核的乙姬也就不再是一個真正意義上的女孩，她從此處於沉睡狀態，為龍宮島默默提供著一切能源，直到因不停的感受和學習島上人們的一切，漸漸理解了人類“生”的含義，才重新睜開了眼睛，走出地下，並幫助島上的人類一起對付北極的Mir，保護著大家。
一切似乎都有了轉機，龍宮島的大家有了“核”的守護，夥伴們在戰鬥中越來越默契，新國聯對龍宮島的陰謀失敗，一騎和道生等人也回到了島上。然而就在龍宮島決定參加以新國聯為首的人類軍對北極Mir的大決戰時，關良卻因駕駛Fafner引起的染色體變化而喪失了意識被同化，緊接著衛也在戰鬥中不幸身亡，接連失去兩個最好朋友的劍司機戶到了崩潰的邊緣，失去了戰鬥下去的意志；總士被突然襲向系統終端的Festum困住，還沒等待一騎和乙姬的援救就被強行帶到了北極；而道生則拼盡全力用與Festum同歸於盡的方法保護了龍宮島……
付出了太多的犧牲，失去了太多的生命，然而這場關係到全人類生死存亡的戰鬥，卻沒有時間可以去悲傷。計畫仍在進一步的進行著，乙姬理解了人類“死”的意義，為進一步保護龍宮島而與島同化。一騎等人放心的把島交給了以可以與人類並存的部分Festum來保護，自己則飛向了北極去迎接最後的戰鬥……
人物介紹
真壁 一騎（まかべ かずき）
15歲中學生 不善於表現自己，沉默寡言、有些拙笨的少年。FAFNER MARK ERF的駕駛員，SynergeticCode形成率是全島最高的，與父親（史彥）一起住，其實都是他在料理家務。
皆城 総士（みなしろ そうし）
15歲中學生。島の代表者?皆城公蔵の息子。冷靜沈著な戰略家で、戦闘時にはファフナー隊の指揮を擔當している。一騎とは幼馴染の間柄。リーダーシップをとり、クラスメートからも信賴されている。
遠見 真矢（とおみ まや）
15歲中學生，一騎、總士的青梅竹馬，有活力朝氣的女孩子，雖然母親（千鶴）是醫者、姐姐（弓子）從事養護教論，她本人卻連繃帶也不會卷。
Festum(費斯騰，費斯托夫、菲斯特姆)分類
Sphinx型 希臘神話中人面獅身的女怪物
Pleiades型 昂星團的七顆主星，出自希臘神話
Core型 核心型Festum，從CoreKiller型上分歧出來的存在
Slave型 春日井 甲洋化為的Festum
Alhenterus型 不明
Master型 主宰型Festum，以人類形態存在的Festum
Fafner機體分類
Titan Model：龍宮島第一代Fafner,不需要Siegfried系統的支持
Nothung Model：龍宮島第二代Fafner，具體如下
Codename Pilot Color
Markelf 真壁 一 騎 蘭 色 (11)
Mark-Sechs 宇佐間 翔子 白 色 (06)
Markvier 春日井 甲洋 棕褐 色
Markdrel 要 (口關)良 橘黃 色 (03)
Markacht 近藤 劍 司 深綠 色 (08)
Markfuenf 小(木盾) 衛 紫灰 色 (05)
Mark-sieben 遠見 真 失 紫 色 (07)
Markzwei (02)
國聯軍量產型號
智慧型型(Gnosis Type)
巨獸型(Megatherion Type)
紅衣魔女型(Babalon Type) 卡諾恩·梅菲斯(Canon Memphis)駕駛的酒紅色機體即此類型
國聯軍最新型號
Zalvertolle Model(日野洋治、遠見光洋開發):
Marksein 真壁 一騎 白色
MarkNicht Festum 黑色(nicht為與sein完全相反的"無"的存在)
名詞解釋
Fafner 傳說中因寶物而變成龍的巨人
Valkyrie 瓦爾基利(女武神),北歐神話中將英勇戰死的勇士的靈魂引向英靈殿Valhalla的女神，共九位
Kharis 北歐神話中的青春女神
Fenrir 北歐神話中的魔狼，奧丁的義弟"Loki"的兒子
Aesir 北歐神話中以奧丁為首的諸主神
Norn 又作Nornen，是北歐神話的命運三女神，和基督教中的Moira為同一存在
Ruge 凱爾特神話中的光明之神
Aegis 古希臘神話中的神盾，Markfuenf所搭載的強力鐳射防護盾
Festom 矽形生命體的總稱，擁有讀心能力，可化為飛行形態和步行形態
Alvis 島內的避難所
CDC 藍鯨系統，掌控島嶼一切情況的大型智慧型電腦
RAILGUN Fafner的武器
Vaferraden 戰鬥時為保護建築物從地下升起隔壁的防禦機構
Nighthelle 島上的各個fafner出擊口
Nibelung 通過套上十個指環與Fafner一體化，是令Fafner啟動系統與人類的神經接續以及完成一體化的系統
龍宮本島 基本的生活處，島外進行了鏡面偽裝
圭樹島 Fafner的棲身所，駕駛員的訓練地
所羅門 島內的防禦系統
SynergeticCode 駕駛員與fafner接續時必須形成的一種大腦狀態
burugiri部隊 空中迎擊部隊
Siegfried系統 只有皆城總士能操作的系統，通過該系統能感受fafner駕駛員的精神狀態，受傷程度等等
Urd之泉 命運之泉，為解析Mir而使用的液體電腦，現作為Alvis的終端伺服器，用以檢測敵人是否接近
Valkyrie之岩 皆城乙姬存身之所
