慈壽寺位於莆田縣江口鎮囊山村,俗稱囊山寺。創建於唐僖宗乾符三年(876年),歷史悠久,是福建省著名古剎,在東南亞佛教界也有一定影響。1983年,被國務院列為漢族地區佛教全國重點寺院。
囊山寺的開山祖師是唐代高僧妙應禪師,初名伏虛庵,後改名延福院。僖宗光啟二年(886年),閩王王審知皈依妙應法師,為祝其母親壽誕,遂將寺廟擴建,並奏請朝廷,賜名“慈壽禪寺”匾額。
妙應(820-898年),俗姓黃,名文矩,字子薰,福建莆田縣人。出家後法名涅槃。常口出讖語,舉止怪誕,行蹤不定。有時坐禪岩洞,數日不食;有時裸臥岩石,任蚊蟲叮咬。因他出行時有兩隻馴虎跟隨,人稱伏虎祖師。他創建的囊山寺名聲遠揚,住寺僧人達千人,寺廟在太平、霞塘、南隱等處擁有田地。妙應法師圓寂後,葬於法堂的塔中,宋時遷於法堂西側,重建寶塔,稱慧薰塔。
宋太祖乾德二年(964年),朝廷又賜慈壽禪寺莊田20頃為寺產,贍養寺僧。宋仁宗景祐初年(1034年,對寺廟又進行了全面擴修,並建起了放目亭、雲濤亭、蒼霞亭、蘸綠亭、石屏軒、松風閣、雲臥堂、白雲堂、海月堂、延壽堂、西來室、幻如室、淨居室、放光室等等。常住僧人數百人。宋高宗紹興二十三年(1153年),24歲的朱熹中進士後到同安縣任簿,在上任途中投宿囊寺,留下詩一首:
曉發漁溪驛,暮宿囊山寺。雲海近蒼茫,溪山擁深翠。
行役倦修程,投閒聊一憩。不學塔中仙,前途定何事?
元至元二十四年(1287年),寺毀於火災。至元二十六年(1366年)住持深公重建殿堂,恢復舊觀。元代末年又毀於戰火,僧眾散盡。
明太祖洪武十一年1378年),住持道傑重建法堂,後續建祖殿。洪武三十一年(1398年),住持湘江法師集資建香積、齋堂及廂房。成祖永樂九年(1411年),住持永清法師
重修毗盧閣、輪藏殿、鐘鼓樓,後一行法師重建大雄寶殿。至宣德八年(1433年),慈壽寺擁的殿堂僧房300多間,重量同重現閩中名剎的風采。嘉靖年間(1522-1566年),慈壽寺遭到三次破壞,寺廟被毀,公輪藏殿和鐘樓倖存。清朝時,寺廟一直衰敗,未能恢復明朝初年的規模。光緒十一年(1885年),住持通源法師手敲木魚,四處募化,重修了大雄寶殿。今天在大雄寶殿還掛著這樣的楹聯:“伏虎初興慈壽寺,敲魚重振古囊山”。1908年,源智、慧賢法師相繼興建禪堂、齋堂、庫房、客室、鐘鼓樓、伽藍殿、祖師殿、功德堂及左右兩廊。1932年住持化光及證明、妙義法師又重建方丈室和山門。這些建築都採用磚木混合結構,至今保存完好。 中華人民共和國成立後,人民政府十分注意囊山慈壽寺的保護和維修工作,支持僧眾按照佛教叢林規章管好這一千年古剎。1951年,在海外僑僧資助下,修建了辟支岩了塔,創建茶毗場,增建了藏經閣。1956年,住持化光法師主持樹立了《囊山慈壽禪寺歷代中興碑記》。到“文化大革命”前,寺中仍住僧30餘人。
“文化大革命”中,僧眾流散,停止了佛事活動。中國共產黨十一屆三中全會以後,宗教信仰自由政策得到恢復和落實。1981年,囊山慈壽寺經政府批准作為佛教活動場所重新開放,僧人重新回到寺內,過著正常的宗教生活,同時募集資金,重塑佛像,對殿堂進行全面修復。1983年,慈壽寺被列為漢族地區佛教全國重點寺廟後,加快修復的步伐。23名僧人發揚“農禪並重”的優良傳統,耕種田地、看護山林,開墾耕地。囊山慈壽寺在海外擁有6個下院,如馬來西亞的紫竹亭、觀音亭、慈光亭,印度尼西亞的金德院、廖內島媽祖宮和茂物福德廟等。近年來,這些下院不斷前來朝拜祖庭,增進了了解和友誼。