區分鑑別芽原基
芽原基頂芽發生在苗端(莖端或枝端)，包括主枝和側枝上的苗端分生組織，而腋芽起源於腋芽原基。大多數被子植
物的腋芽原基發生在葉原基的葉腋處，腋芽原基的發生晚於葉原基。腋芽的起源很像葉，在葉腋處的一些細胞經過平周分裂和垂周分裂形成突起，細胞排列與苗端相似，並且其本身也可能開始形成葉原基。不過，在腋芽形成過程中，當它們離開莖端一定距離以前，一般並不形成很多葉原基。
莖上的葉和芽起源於分生組織表面第一層或第二、三層細胞，這種起源方式為外起源。不定芽的發生和頂芽、腋芽不同，它的發生與一般苗端分生組織無直接關係，它們可以發生在插條或近愈傷組織、形成層或維管柱的外圍，甚至在表皮上，以及根、莖、下胚軸和葉上。不定芽的起源依發生的位置可分為外生的(靠近表面發生的)和內生的(深入內部組織中發生的)兩種。當開始形成時，由細胞分裂組成分生組織，當這種分生組織形成第一葉時，不定芽與產生芽的原組織結構之間建立起維管組織的連續，而這種連續就是由不定芽的分化和原有的維管組織相接而形成的。
芽軸
將芽縱切，用放大鏡觀察，可見芽的中央有一個中軸，就是芽軸，它的頂端有生長點。在芽軸上部，節和節間界限不明顯，芽軸周圍有許多葉原基和芽原基。芽軸的下部，節與節間開始分化，芽軸被幼葉層層包裹著，保護著芽軸頂端的生長點。由此可見，芽軸是未發育的莖，其以後可以發育成莖。它具有節間距離很小的節，節上有幼葉，葉腋里有側芽，頂端有頂芽。
