華萊士原是一個基督教徒,相信特創論和物種不變論。在廣泛地接觸了動物界和植物界以後,才認識到物種是可變的。1855年,當他在婆羅洲(現名為加里曼丹)的沙撈越時,發表了《論控制新物種發生的規律》的短文。在文章里他說:“每一物種的出現都與早已存在的密切相近的物種在時間上和空間上是一致的”,已表現出明確的進化觀點,但對進化機制尚一無所知。1858年2月,他在南洋的馬六甲島患瘧疾中,思考人類進化問題,想起所讀過的T.R.馬爾薩斯《人口論》,從而得到啟發想到“最適者生存”的道理。他隨即寫了《論變種極大地偏離原始類型的傾向》的論文。提出以自然選擇原理來說明物種的起源,並立即把文稿寄給達爾文。達爾文於1858年3月9日收到,即按照華萊士的要求,把文稿轉給地質學家C.萊爾,經過萊爾和植物學家J.D.胡克的安排,把達爾文和華萊士有關進化學說的論文共同於1858年 7月1日晚上在倫敦林奈學會上宣讀,惜於當時沒有引起重視。引起激烈爭論的是1859年出版的《物種起源》。
華萊士很讚許《物種起源》,並認為只有達爾文才能提出如此豐富的論據和雄辯的邏輯來論證生物的進化和自然選擇學說,並使進化觀點取得了決定性的勝利。但是,他的進化觀點與達爾文的並不完全一致,特別是在人類起源問題上更是如此。他與亞馬孫流域和馬來群島的未開化人有廣泛的接觸,有根據地認為全世界的人都是一家,未開化的人在智慧上不亞於文明的人,只是他們的文化落後罷了。
他認為人類和動物有不可逾越的鴻溝。對人類肉體,他與達爾文一樣,認為是自然選擇的產物;但對智慧,他認為不可能由自然選擇來決定,而是由非生物學因子即超自然的力量上帝乾預決定的。他也不同意達爾文的性選擇學說。他認為雌鳥不漂亮對生存有利,只是自然選擇而不是性選擇的結果。
達爾文逝世後,在英國大力宣傳達爾文主義的是他和J.赫胥黎。他於1886~1887年應邀到美國去巡迴講學,大力宣傳進化論。
對動物地理分布,華萊士有重要貢獻。他根據哺乳類的分布情況,把全世界的動物分布劃為若干區,各區有自己的特點。他提出位於龍目島和里巴島之間有一條深溝,溝以東是澳大利亞區的動物類型,溝以西是亞洲區的動物類型。他所發現的這條線(即華萊士線)以及動物地理的分布區域,到現在仍然大部分有效。
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