主要分類
自然保護區的類型一般可以根據保護對象、保護性質、管理系統的不同而有不同的分類方法，概括起來有以下幾種分類：
①根據自然保護區保護對象進行分類：具有代表不同自然地帶典型的自然綜合體及其生態系統或遭破壞急待恢復和更新的同類地區；具有本國特產的或世界性珍貴稀有物種，或具有重要經濟意義而瀕於滅絕的生物種的地方；具有其他特殊意義的地區，如水源涵養地、島嶼（鳥島、珊瑚礁）、地質剖面、冰川遺蹟等自然遺產所在地，或具有科學教育和文化上有必要保護的地方；具有自然歷史遺蹟、名勝風景或革命歷史聖地等所在地外圍的自然環境和文化景觀的地區。
②按自然保護區的性質和任務進行分類：自然保護區，是保護或恢復自然綜合體和自然資源整體為主的地區，在其所劃定的範圍內，嚴禁生產經營性的活動，也稱永久保護區；國家公園、自然公園，是屬於保護或恢復自然綜合體的一種保護區，同時又具有園林性的經營管理，可做為旅遊場所，也可包括一定的自然風景區，以及名勝古蹟；禁獵區：包括禁獵區、禁伐區、禁漁區、儲備地、動物生卵場保護區等，在一定時期內，規定保護和恢復某些特定的自然資源；原野地，一般指較偏的荒漠原野，很少有人為活動的影響，為長遠考慮而劃為保護區。
③按自然保護區管理系統進行分類：國家級，指由國家中央管理的保護區，如我國的四川臥龍、陝西佛坪及甘肅白水江自然保護區；地方級，指由省（區）、市、縣管轄的保護區。
主要目的
保護區的不同類型和保護區內的分區都是為了明確日常保護經營管理的方針和措施。保護區的分區管理不能認為保護區就是綜合性經營或屬多種經營的管理區。明確自然保護區不同類型的作用，可以避免對保護對象採取不適當的措施而引起不應有的損失。
必須強調的是，自然保護事業的範圍遠不限於保護區。自然保護區是保護、合理利用、監測和改造自然環境和自然資源整體的戰略基地，是自然生態系統和生物種源的一個儲備地，它象國家保護的歷史文物一樣，是國家保護自然歷史遺產的重要設施，是當產建立保存各種主要自然生物群落的典型代表和特定的物種，使它不受任何干擾，供各方面長期的需要，是十分重要的儲存庫。自然保護區也是貫徹一個國家合理利用自然資源，特別是野生生物資源的方針和措施的樣板。保護區對維護生態平衡、改善人類環境、保持水土、涵養水源起著積極的作用。
