雖然在戰國時代，臣下違抗主命的行為常有發生，但進入江戶時代後，將脫藩視為“以臣下之身背叛主上”而無法原諒的風潮高漲，藩主有時也會下令追捕脫藩者。這是因為藩主擔心脫藩者很可能會泄露藩中的軍事秘密或御家騷動之類的情報，而導致發生改易。
在江戶時代中期以後，由於日本進入和平時代，軍事機密也就毫無意義了。所以如果不是藩中的重要人物，事實上是允許因為財政方面的問題而自由脫藩的。只是此種情況需要完成一定的法律上的手續。如有未經手續擅自脫藩的情況，脫藩者將被冠以施以欠落（出奔）的罪名，將會斷絕其家名並將沒收財產，本人被抓住時根據情況亦可能被施以死刑。
到了幕末，尊王攘夷思想逐漸興起，由於無法自由活動，越來越多的武士選擇脫藩，到江戶和京都與志同道合的人交流，投身政治活動，所以各藩對脫藩行為也漸漸默許，不再追究。 歷史上有名的脫藩者有長州藩的吉田松陰、土佐藩的坂本龍馬與中岡慎太郎等。
