能量最佳化方法

能量最佳化方法（Energy Minimization Method）即尋找研究體系能量極小的狀態，從數學角度看是處理多維函式的最佳化問題。
常用的方法有：1.直接搜尋法（Direct Search Method）；2.最陡下降法（Steepest Descent Method）；3共軛梯度法（Cojugate Gradient Method）；4.擬牛頓法（Quasi-Newton Method）。
能量最佳化方法的局限性：1.該方法依賴於初始構型的選擇，即Em方法只能找到初始結構附近的局部極小結構；2.體系不可能跨越較大的勢壘，因此EM不能找到全局極小。
相比模擬退火方法（Simulated Annealing）通過體系升溫然後再降溫，可使體系增加較大的動能，從而使體系可以跨越較高的勢壘而達到更低的能量構象。因此，模擬退火是尋找全局極小的較好方法。