故事內容
黑暗女王復活篇
阿兔她們已經升上高中了，阿兔、亞美、真琴、美奈子同考入十番高中。被封印在鏡中的死亡月亮納尼莉婭女王，被一把神秘的聲音喚醒，那人替她解除封印，並煽動她的仇恨情緒，使她對美少女戰士作出報復。她派出鏡之舞娘襲擊戰士們，並藉流星雨把鏡之碎片植入阿衛的身體內，慢慢控制阿衛。為了應付此一危機，剎那從未來回到十番商業街並從土萌教授那裡接回阿螢，去找阿遙和美智留，再次加入戰鬥。鏡之舞娘襲擊外部戰士四人，仍是嬰兒的阿螢被激發出力量，幫助其餘三位外部戰士變成為SuperSailorUranus、SuperSailorNeptune和SuperSailorPluto。阿螢經此一役，身體和心智迅速成長，並再度醒覺，成為SuperSailorSaturn。所有美少女戰士齊集，集合力量使阿兔變成終極形態Eternal Sailormoon。眾人擔心阿衛，趕到他家時，他已被納美妮亞控制，帶走了。阿衛因為失去本性，不再愛阿兔，令他們的愛情結晶小小兔也慢慢消失。本來要變成Eternal Sailormoon是要靠眾人之力的，但阿兔救阿衛和小小兔心切，竟能獨自變成Eternal Sailormoon，自己一個去納美妮亞那裡救人。其他戰士也跟著追去，其間被納美妮亞把她們分開，各個擊破，封印在鏡中。阿兔終於找到納美妮亞和迷迷糊糊的阿衛，SuperSailorChibimoon就在阿兔的懷內消失。納美妮亞訴說自己悲慘的過去，阿兔聽了，只感到同情、可憐她，不再憎恨她，願意讓她報復，阿兔相信眾人都會願意和納美妮亞做朋友的。被封印的眾戰士和阿衛都感動落淚，所有的封印解除，SuperSailorChibimoon亦重現世上。眾戰士集合力量，阿兔變成Eternal Sailormoon，引導納美妮亞找回她真正的夢想。
嘉拉西亞篇
阿衛要去美國留學，臨走前送了一隻訂婚戒指給阿兔，二人難捨難離。阿衛上機後，一道強光向他的飛機襲來……就在阿兔送別阿衛時，在機場出現了最新的人氣組合——星光三劍俠(ThreeLights)，成員包括星野光、大氣光和夜天光。星野和阿兔、阿衛擦身而過，他被阿兔吸引住了。新敵人襲擊人類，要收集人類能量，找出擁有真正星宿種子的人，但這次的敵人竟然也是美少女戰士！除此之外，又有三位來歷不明的美少女戰士SailorStarLights出現，她們有時會幫助內部戰士。星光三劍俠轉校來到十番高中，還坐到阿兔她們的附近。對阿兔有好感的星野，經常和阿兔在一起，而阿兔也對他漸生好感。經過一輪戰鬥，內部戰士和SailorStarLights對彼此的認識加深了，阿兔正想和她們共同作戰，外部戰士突然歸來，並反對和SailorStarLights合作。一天，神秘的小女孩小兔子從天而降，她令阿兔的家人相信她是阿兔的妹妹，從此寄住月野家。小兔子的真正身份沒人知道，不過人人都喜歡她。在一次作戰中，Eternal Sailormoon的權杖跌在地上，小兔子拾起它時，發出一道溫暖的光，小兔子並變身成美少女戰士SailorChibiChibimoon。這一道光引起了SailorStarLights和嘉拉西亞的注意。阿兔變身時不慎被敵人見到，敵人於是利用星光三劍俠飛機上的試映會作陷阱，引阿兔到來。在飛機上，為了救阿兔，星野不惜揭穿自己的真正身份——SailorStarFighter，也要保護阿兔。星光三劍俠就是SailorStarLights，內部戰士的身份也被揭穿。敵人在戰鬥中偷襲Eternal Sailormoon，星野撲上去替她擋下那一擊，身受重傷。另一方面，小兔子拾得一個紅色的香爐，內里有時會有一隻紅色的蝴蝶出來飛舞。星光三劍俠發現了那香爐，確定那香味就是他們一直找尋的公主——火球公主獨有的氣味，便想逼小兔子交出香爐。這時候，敵人出現以黑洞要脅，要奪走阿兔的星宿種子，阿兔為了大家的安全，無奈接受。因為敵人內哄，黑洞被釋放，阿兔和小兔子也被卷了進去。危急關頭，小兔子手上的香爐發出強光，火球公主出現。火球公主講述遠古時代的美少女戰士大戰傳說，請求大家幫助找尋希望之光。就在找尋希望之光的星光三劍俠演唱會上，敵人首腦嘉拉西亞出現，殺死了火球公主。美少女戰士查出了敵人大本營在銀河電視台，美少女戰士各自出發，找嘉拉西亞作最後決戰。SailorStarLights首先來到，內部戰士也在SailorChibiChibimoon的幫助下來到。嘉拉西亞突然攻擊，要奪取Eternal Sailormoon和SailorStarLights的星宿種子，內部四戰士以身相擋，救了她們，自己則消失。嘉拉西亞對Eternal Sailormoon證實是她殺死阿衛的，Eternal Sailormoon情緒完全失控。外部戰士明白自己的力量不及嘉拉西亞，於是想用計騙得嘉拉西亞的信任，乘機把她的星宿種子打出來。首先要犧牲的是SuperSailorPluto和SuperSailorSaturn，Eternal Sailormoon誤以為SuperSailorUranus和SuperSailorNeptune出賣同伴。外部戰士的苦肉計因為嘉拉西亞沒有星宿種子而宣告失敗，SuperSailorUranus和SuperSailorNeptune也消失了。戰鬥到此，地球上的戰士就只剩下Eternal Sailormoon一人，她失去了鬥志。經SailorStarLights的鼓勵回復鬥志的她，再戰嘉拉西亞，卻驚聞嘉拉西亞就是傳說最強的美少女戰士——Sailor Galaxia！嘉拉西亞在遠古大戰後，釋放出她的星宿種子——希望之光，然後身體就逐漸被體內的惡魔混沌侵占了。SailorChibiChibimoon聽完掉下眼淚，原來她就是希望之光，現在覺醒化成封印之劍，請求阿兔用它來拯救銀河系。阿兔猶豫，最終還是拿起劍，刺傷嘉拉西亞，不過封印之劍也被嘉拉西亞斬碎，SailorChibiChibimoon消失。阿兔相信仍留嘉拉西亞內心的希望碎片，伸出手飛向嘉拉西亞。
登場角色
| 姓名 | 動畫 | 漫畫 |
| 月野兔 | √ | √ |
| 水野亞美 | √ | √ |
| 火野麗 | √ | √ |
| 木野真琴 | √ | √ |
| 愛野美奈子 | √ | √ |
| 小小兔 | √ | √ |
| 地場衛 | √ | √ |
| 天王遙 | √ | √ |
| 海王滿 | √ | √ |
| 土萌螢 | √ | √ |
| 冥王雪奈 | √ | √ |
| 大氣光 | √ | √ |
| 星野光 | √ | √ |
| 夜天光 | √ | √ |
| 露娜 | √ | √ |
| 亞提密斯 | √ | √ |
| 嘉拉西亞 | √ | √ |
| 火球公主 | √ | √ |
| 水手小小 | √ | √ |
| 妮赫蕾妮亞 | √ | × |
| 水手四重奏 | × | √ |
| 水手鐵鼠 | √ | √ |
| 水手錫貓 | √ | √ |
| 水手鉛烏鴉 | √ | √ |
| 水手鋁海妖 | √ | √ |
| 水手重金屬蝴蝶 | × | √ |
| 水手記憶川 | × | √ |
| 水手忘卻川 | × | √ |
| 水手φ | × | √ |
| 水手Χ | × | √ |
分集劇情
| 本部數 | 總集數 | 中文標題 |
| 第1話 | 第167話 | 噩夢之花散開之時！黑暗女皇復活 |
| 第2話 | 第168話 | 土星覺醒！水手十戰士集合 |
| 第3話 | 第169話 | 詛咒的魔鏡！被惡夢困住的小衛 |
| 第4話 | 第170話 | 命運的一夜！美少女戰士的苦難 |
| 第5話 | 第171話 | 因為愛！無止盡的魔界之戰 |
| 第6話 | 第172話 | 愛的月之力量！噩夢結束之時 |
| 第7話 | 第173話 | 離別與邂逅！命運之星的流動 |
| 第8話 | 第174話 | 吹進校園的風暴！轉學生是偶像 |
| 第9話 | 第175話 | 以偶像為目標！美奈子的野心 |
| 第10話 | 第176話 | Fighter的真正身份！衝擊性的超級變身 |
| 第11話 | 第177話 | 寄予星星的夢與浪漫！大氣的變身 |
| 第12話 | 第178話 | 露娜見到了！？偶像夜天的真面目 |
| 第13話 | 第179話 | 是敵？是友？StarLights與美少女戰士 |
| 第14話 | 第180話 | 互相召喚的星之光芒！小遙等人參戰 |
| 第15話 | 第181話 | 星野與小兔心跳加速的約會 |
| 第16話 | 第182話 | 來自宇宙的入侵者！Siren的飛來 |
| 第17話 | 第183話 | 亡靈的叫喊！恐怖的營區怪人 |
| 第18話 | 第184話 | 兩人獨處的夜晚！小兔的危機 |
| 第19話 | 第185話 | 大氣絕唱！傳達信念之心的歌聲 |
| 第20話 | 第186話 | 小兔子之謎？超級追擊行動 |
| 第21話 | 第187話 | 星星光芒的力量！小兔子的變身 |
| 第22話 | 第188話 | 恐怖的招待！ 阿兔的夜間飛行 |
| 第23話 | 第189話 | 使命同友情之間！水手戰士的對立 |
| 第24話 | 第190話 | 暴露了的真實！星野他們的過去 |
| 第25話 | 第191話 | 光芒之蝶舞動之時！新衝擊的預感 |
| 第26話 | 第192話 | 朝夢想勇往直前！偶像美奈子誕生？ |
| 第27話 | 第193話 | 被奪走的銀水晶！火球公主現身 |
| 第28話 | 第194話 | 銀河聖戰Sailor Wars傳說 |
| 第29話 | 第195話 | 火球公主消失！嘉拉西亞降臨 |
| 第30話 | 第196話 | 銀河毀滅之時！水手服戰士最後的戰役 |
| 第31話 | 第197話 | 銀河的統治者！凱拉克西雅的威脅 |
| 第32話 | 第198話 | 逐漸消失的群星！天王星等人的死期 |
| 第33話 | 第199話 | 希望之光！為了銀河的最終決戰 |
| 第34話 | 第200話 | 小兔的愛！月光照亮銀河 |
