變化特點
第六世代主系列遊戲中首次出現了騎乘口袋妖怪。
新增變更主角形象的功能。
新增妖精屬性。
新增口袋妖怪友誼系統。
新增群聚對戰和空中對戰。
新增玩家搜尋系統。原有的口袋妖怪中心二樓及全球終端被整合到此系統。
新增超進化，部分口袋妖怪可以通過超進化石和鍵石在對戰中進化。
新增超級訓練系統。新增換裝系統。新增奇蹟交換。
新增直排輪，比原先的跑步鞋速度更快，只要使用類比墊移動就可以激活輪滑鞋。
經驗值獲得方式有所變化，即使捕獲野生的口袋妖怪，也都能獲得經驗值。且如果在口袋妖怪升級後進化時取消進化，該口袋妖怪獲得的經驗為原來的1.2倍。
學習裝置變為了重要道具，可以隨時開關，所有攜帶的口袋妖怪均可獲得50%的經驗值，無需讓口袋妖怪攜帶。
皮卡丘的聲音改變成動畫中大谷育江的配音。
新增自然物品，在對戰中可以使用特定招式獲得道具。
細節
官方並沒有第幾世代的稱呼，第幾世代是口袋妖怪的愛好者之間互相討論時所使用的詞。在中國一般以XY世代、3DS世代來指代第六世代。
雖然第六世代被認為處於3DS時期，但是從2011年3DS發售直至2013年10月12日XY版發售近兩年的時間出品的遊戲均算作第五世代。
第五世代至第六世代的跨世代傳輸是唯一的一次需要利用官方伺服器，另外購買的軟體以及付費服務。
第六世代是口袋妖怪數量新增最少的一代，共有72種，雖然算上百萬進化的話就超越第二世代的100種了。
歷代遊戲
主系列| 第一世代（ 1996—1999） | 口袋妖怪紅·綠，口袋妖怪藍；口袋妖怪黃 |
| 第二世代 （1999—2002） | 口袋妖怪金銀；口袋妖怪水晶 |
| 第三世代（ 2002—2006） | 口袋妖怪紅寶石·藍寶石、口袋妖怪綠寶石；口袋妖怪火紅葉綠版 |
| 第四世代（ 2006—2010） | 口袋妖怪鑽石珍珠、口袋妖怪白金；口袋妖怪心金魂銀 |
| 第五世代（ 2010—2013） | 口袋妖怪黑白；口袋妖怪黑白2 |
| 第六世代（2013—） | 口袋妖怪XY；口袋妖怪終極紅寶石·始源藍寶石 |
| 保育家（守護者）系列 | 口袋妖怪守護者、口袋妖怪守護者2：融合、口袋妖怪守護者：光之軌跡 |
|---|---|
| 不可思議迷宮系列 | 赤之救助隊·口袋妖怪不可思議的迷宮：青之救援隊·冒險團系列（炎之冒險團·嵐之冒險團·光之冒險團）；口袋妖怪：不可思議迷宮時之探險隊·口袋妖怪：不可思議迷宮暗之探險隊·空之探險隊；不思議的口袋妖怪迷宮：瑪古那之門與無限迷宮 |
| 競技場系列 | 口袋妖怪競技場·口袋妖怪競技場2·口袋妖怪競技場金銀； 圓形競技場·口袋妖怪XD暗之鏇風·口袋妖怪戰鬥革命 |
| 任天堂大亂鬥系列 | 明星大亂鬥·大亂鬥DX·大亂鬥X |
| 大紛爭系列 | 亂戰！口袋妖怪大紛爭；超級口袋妖怪大紛爭 |
| 你好皮卡丘系列 | 皮卡丘你好嗎·頻道·皮卡丘的大冒險 |
| 卡片GB系列 | 卡片GB·GR團參上！ |
| 其他卡片遊戲 | PTCGO·玩法教學DS |
| 彈珠檯系列 | 彈珠檯·彈珠檯紅藍寶石 |
| 方塊系列 | 方塊·方塊聯盟（僅海外） |
