《空想科學大戰》的重點是對各式漫畫、動畫、特攝設定用真實科學去驗證其可行性，和柳田理科雄的作品《空想科學讀本》有相似的概念，但是《空想科學大戰》是以有劇情的科普漫畫的方式，來引導讀者看透空想科學不合理的地方，同時提出較為科學的解決方案。
劇情大意
公元200X年，宇宙帝王魔多向地球發出侵略宣言，並向地球派出巨大怪獸，同時巨大人形英雄向怪獸出現地點高速飛來。但是，巨大怪獸著陸不久便因體重而垮台，英雄則因超越音速後被自己發出的衝擊波切斷了頭部。對於一切貓柳田博士解釋這是因為“科學之壁”的存在……第1卷，“巨大英雄對巨大怪獸”，第2卷“改造人們的戰鬥”，第3卷“巨大機器人的戰鬥”，第4卷是“三大英雄對大自然的威脅”，第5卷是“在宇宙中的戰鬥”。各卷的英雄和敵人的原型從第1卷依次取材於《奧特曼》、《假面騎士》、《魔神Z》，第4卷，全部的英雄集結，第5卷的故事背景取材於《宇宙戰艦大和號》。
主要角色
全作品共通的登場人物貓柳田愛吉
作品中的每一卷都有出場的人物，可以說是本作的地下主角，在作品中進行科學說明，並為主角提供支援。右眼帶著眼罩，留著銀色的長髮，從第2卷開始就常常帶著貝雷帽，每一卷中的職業都不同。《Dr.貓柳田之科學的青春》中為主角。
魔多
自稱宇宙帝王，長的像地球的狗的宇宙人。前來侵略地球（或者說日本），可是所有的計畫都因英雄們的活躍或“科學之壁”的阻擋而失敗。雖然有製造怪獸或改造人的技術，但科學知識的水平卻很糟糕。在《Dr.貓柳田之科學的青春》中有出現他的兒童時期。
巴奇
魔多的忠實部下。外形像地球的猩猩的宇宙人，對魔多大王絕對忠誠，但常因多嘴而被懲罰。在《Dr.貓柳田之科學的青春》中也有出現。
絲巾
魔多雇用的女僕，是個可愛的少女。比魔多大王更精通科學，改造手術，新藥開發這樣的技術方面也有很高的能力。對每一卷的主角都一見鍾情，為了把他們變成自己的人，而主動幫助魔多侵略地球。
第一卷登場人物
殺魔攻擊隊(SAMON)
日本科學攻擊隊(Sience Atack Members Of Nipoon)的簡稱，總部位於富士山腳下的湖畔。
淺羽墓穴
殺魔攻擊隊隊長，武器和戰機設計方面相比實用性更注重帥氣，結果因為不符科學原理而失敗，常因不靠譜的想法給周圍隊員添麻煩。
宇留鷲綺麗
沙魔攻擊隊隊員，全隊唯一的女性，喜歡料理，但只會做出殺人料理，也擅長下棋。
宇和野空吉
沙魔攻擊隊隊員，常和隊長一起行動，愛好是釣魚。
佐佐八木心理
沙魔攻擊隊隊員，存在感很低，單戀宇留鷲隊員，但對方完全沒有意識到。愛好是下棋，但實力很弱。
非科學遊戲
沙魔攻擊隊新隊員，真實身份是ウーターマン。因為符合隊長中心目中理想隊員形象，連入隊考試都沒用參加。年齡不明，不過，行為和24歲的人一樣。
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