秈稻與粳稻
秈稻
秈稻秈稻一般株高多在1m以上，莖稈較軟，葉片寬，色澤淡綠，劍葉開度小。葉片茸毛多，有短小茸毛散生於穎殼。大多為無芒或短芒，穀粒細長而稍扁平，一般長度為寬度的二倍以上。穀粒易脫落。較耐濕、耐熱和耐強光，但不耐寒。米粒直鏈澱粉含量較高，膠稠度硬，故蒸煮的米飯不粘。
粳稻
粳稻粳稻，稻的一種(Oryza saliva subsp keng)，莖桿較矮，葉子較窄，深綠色，米粒短而粗，其米粒不粘。粳稻籽粒闊而短，較厚，呈橢圓形或卵圓形。籽粒強度大，耐壓性能好，加工時不易產生碎米，出米率較高，米飯脹性較小。
互補性
秈粳亞種雜交稻三系雜交秈稻跟粳稻的互補性還表現在很多方面。在生長差異方面，秈稻前期生長快，但後期的經濟係數低，“也就是說稻穀占整個稻草的比例低”，馬榮榮稱，但粳稻前期生產慢，但經濟係數卻要高不少；在對溫度的適應性上，秈稻耐高溫卻不耐低溫，而粳稻耐低溫卻不耐高溫；在抗病性上，秈稻的抗稻瘟病強於粳稻，但粳稻的抗白葉枯病又強於秈稻。“我們做的就是將分散在不同個體上的有利因素集中在同一個個體上，形成相對穩定的群體，供人類利用。”馬榮榮說，秈粳雜交稻就像一個混血兒，遺傳了父母的優勢基因，不僅有秈米的蓬鬆清香，又有粳米的柔滑微甘，而且雜交後的水稻氣株型結構還具備了超高產的支撐能力，產量提高非常明顯。
研究方向
亞種間雜交稻具有較品種間雜交稻更強的雜種優勢，是20世紀90年代以來中國超級稻育種研究中的最主要途徑。實踐證明亞種間雜交稻組合具有明顯的生長優勢和產量優勢，生產潛力巨大[1，2]。但許多研究指出[3-6]，亞種間雜交稻普遍存在抽穗後功能葉早衰的現象，不少具有高產潛力的品種(組合)尤其如此。
現有成果
目前該項目已經有甬優4號、甬優6號、甬優9號和甬優11號四個品種，以甬優6號為例，其最高畝產已經達到了834.6公斤，比普通晚稻每畝增產80公斤。
