福建醫科大學消化系病研究室掛靠福建醫科大學附屬第一醫院消化內科，現有碩士研究生導師4名，博士4名，碩士3名，每年在讀碩士研究生10多名。近年先後主持了包括國家自然科學基金在內的數十項科研課題的研究工作，與境內外的多家著名科研機構有著密切聯繫。本研究室已發表研究論文150多篇、科普文章30多篇；研究成果獲衛生部科技進步獎1次、省級科技進步獎5次。
本研究室是我省消化系統疾病診斷、治療和醫學人才培養的中心之一，主要研究方向有：胃癌的防治研究、胃腸道功能性疾病的基礎和臨床研究、胰腺疾病的基礎和臨床研究等，部分研究處於國內先進水平。消化內鏡室配備有先進的電子胃鏡、腸鏡及附屬治療設備，能夠進行胃腸道疾病的診斷和治療，為臨床各科室提供快捷、優質的服務。門診人數、住院病人數、內鏡檢查和治療人數每年以30%的增幅遞增，為消化內科疾病的基礎和臨床研究提供了堅實的基礎。本研究室面向全國招收研究生，每年在讀碩士研究生10多名。每2年還舉辦1屆福建省消化疾病進展學習班，從2004年開始每年舉辦國家級繼續醫學教育項目消化疾病進展學習班。
先後主持了國家自然科學基金、國家衛生部科技技術研究基金、國家教育部骨幹教師基金、福建省自然基金、福建省科技廳、福建省教育廳科研基金、福建省科技三項費基金、福建省衛生廳青年基金、福建醫科大學研究基金和福建醫科大學附屬第一醫院青年基金等資助課題的研究工作。發表研究論文150多篇、科普文章30多篇；研究成果“功能性消化不良患者胃動力、胃腸激素和幽門螺桿菌的系列研究”獲得1999年衛生部科技進步三等獎和2000年上海市科技進步三等獎、“消化性潰瘍的基礎和臨床系列研究”獲得2002年福建省科技進步三等獎、“肝硬化腹水的基礎與臨床系列研究”獲得1996年福建省醫藥衛生科技進步獎、“腸道菌群失調的基礎和臨床系列研究）獲得1997年福建省醫藥衛生科技進步獎，等等。
參與全國大專版《內科學》教材的編寫，主編、參編、翻譯各種醫學專著、科普讀物、教材17本。
