機構簡介
皇崗出入境檢驗檢疫局於1999年11月由原皇崗動植物檢疫局、皇崗衛生檢疫局、皇崗進出口商品檢
檢驗檢疫徽章皇崗檢驗檢疫局管轄區域包括皇崗口岸、福田口岸以及深圳市福田區進出口企業，負責貫徹執行“四法三條例”。主要負責實施出入境衛生檢疫、口岸衛生監督；負責實施出入境動植物及其產品和其它應檢物的檢驗檢疫與監督管理；負責實施進出口商品（含食品）的檢驗與監督管理；負責實施進出口質量許可制度、認證與監督管理；負責出入境車輛（含貨櫃）、貨物及其包裝物、鋪墊材料的衛生除害處理工作；負責行政處罰工作；承辦深圳檢驗檢疫局交辦的其它工作。
內設科室
皇崗檢驗檢疫局下設8個部門，包括辦公室、人事處（政工處）、綜合業務處、監管處、貨檢處、旅檢一處、旅檢二處及機關服務中心皇崗分中心。
發展歷程
皇崗口岸開通以來，皇崗檢驗檢疫局全體幹部職工積極投身於口岸檢驗檢疫工作，在促進深圳市經濟社會又好又快發展的同時，自身也在不斷地發展壯大。由於皇崗口岸的特殊性以及口岸檢驗檢疫業務類型的代表性，深圳檢驗檢疫系統許多業務改革試點工作確定在皇崗口岸進行，並經試點成功後向其它口岸推廣套用。
其中包括：
1、1998年5月，皇崗口岸“三檢”作為全國檢驗檢疫系統機構改革的試點，在全國檢驗檢疫系統率先成功實施“六個一”檢驗檢疫業務改革試點工作；
2、1999年11月28日，皇崗口岸“三檢”部門順利完成機構改革，成立了皇崗出入境檢驗檢疫局；
3、2000年，為促進口岸科學把關，高效服務，推動檢驗檢疫信息化建設。深圳局為在深圳檢驗檢疫系統內全面推廣CIQ2000業務，率先在皇崗口岸試點運行CIQ2000系統。通過完成相關測試及總結後，在深圳局範圍內全面推廣。
4、2003年，為了提高口岸通關速度，最佳化檢驗檢疫通關環境，皇崗局在深圳局黨組的領導下和機關業務處室的指導下，大力推進、實施“大通關”戰略，進一步加強信息化建設工作，全面啟動運行電子報檢、電子簽證、電子轉單“三電工程”，並在此基礎上積極配合參與開發公路口岸電子快速查驗系統；
5、2003年8月14日，國家質檢總局大通關的 “公路口岸快速查驗系統” 現場演示會在皇崗局舉行。有關係統的開發套用受到時任國務院副總理吳儀同志、國家質檢總局李長江局長等領導以及與會代表的高度讚揚。
6、2004年，皇崗局按照深圳局的要求，制定了CIQ2000系統“大集中”工作方案，對下屬各部門業務流程進行調整和改革，在對CIQ2000外掛軟體進行升級測試後，於當年 11月14日，率先成功完成CIQ2000系統“大集中”切換工作。
7、2005年，皇崗局開始探索陸路口岸建設電子導引系統。同年，深圳局幹部職工考核評價系統率先在皇崗試點成功。
8、2006年，深圳局行政處罰計算機管理系統率先在皇崗局試點成功。
9、2007年，深圳局電子監察系統率先在皇崗局試點成功。
10、2008年，陸路口岸電子通道系統率先在皇崗口岸試運行。
