田漢雲教授學術專長為中國古代文學研究、中國古代學術史研究及揚州文化研究。已出版專著《中國近代經學史》，《六朝經學與玄學》、《清代山東名儒》、《六朝文化》（合著）；編著《左庵詞箋注》、《中國古代白話神魔小說精品選》、《元曲百科詞典》（合撰）、《落日輝煌話揚州》（合撰）、《揚州大觀》（合撰）；與人合作整理的《馮夢龍全集》、《嘉定錢大昕全集》。在海內外學術刊物發表論文50餘篇。有不少研究成果受到學術界的關注，《光明日報》、《文匯報》、《博覽群書》、《漢學研究通訊》、《經學研究論叢》、《中國文哲研究通訊》、《全國高校文科學報文摘》、《報刊複印資料》等海內外刊物予以轉載、刊發摘要或載文述評。《中國近代經學史》被譽為“較傑出的經學史專著”。其代表性成果曾獲江蘇省哲學社會科學優秀成果一、三等獎、全國及華東地區優秀古籍圖書獎。
田漢雲教授先後完成國家及江蘇省重點圖書出版規劃項目、江蘇省社科規劃項目、全國高校古籍整理委員會古籍整理項目、江蘇省教育廳社科研究項目。目前承擔的主要研究項目有國家清史編纂工程主體類項目《清代樸學志》、全國高校古委會項目《汪中著作輯校》、江蘇省社科規劃項目《蘇中傳統文化資源開發利用研究》、《揚州學派文獻整理》等。
