生化處理是利用微生物的生命活動過程將廢水中的可溶性的有機物及部分不溶性的有機物有效地去除，使水得到淨化。事實上，我們對生化處理並不是很陌生的，天然的水體中存在著一條食物鏈，即大魚吃小魚，小魚吃蝦米，蝦米吃小蟲，小蟲吃微生物，微生物吃污水，如果沒有這條食物鏈，自然界就要亂套了。在天然的河流中，有著大量的、依靠有機物生活的微生物，它們日日夜夜地將人們排入河流中的有機物（如工業廢水、農藥化肥、糞便等等有機物質）氧化或還原，最終轉化為無機物質，如果沒有微生物的存在，我們周圍的河流，少則幾個月，多則一、二年，就會成為臭河了，只是由於微生物太微小太分散，以致人們的肉眼看不見罷了。而廢水的生化處理工程則是在人工條件下對這一過程的強化。人們將無以計數的微生物全部集中在一個池子內，創造一個非常適合微生物繁殖、生長的環境（如溫度、pH值、氧氣、氮磷等營養物質），使微生物大量增殖，以提高其分解有機物的速度和效率。然後再往池內泵入廢水，使廢水中的有機物質在微生物的生命活動過程中得到氧化降解，使廢水得到淨化和處理。與其他處理方法相比，生化法具有能耗低、不加藥、處理效果好、處理費用低等特點。
技術說明
1.高效曝氣池
採用高效表面曝氣機，使整個反應區內污水與活性菌膠團充分混合，起到充分攪拌作用；同時在表面形成浪花，與空氣充分接觸充氧。這樣在高速的混合狀態下，廢水中的有機物被菌膠團吸附水解，而後被微生物分解成二氧化碳和水及其他小分子物質。
2.菌膠團——活性污泥的結構和功能的中心
菌膠團有很強的吸附能力和分解有機物的能力，它對有機物的吸附和分解為原生動物和微型後生動物提供了良好的生存環境。其生化特性表現為：以細菌和真菌為主，兼有原生動物和後生動物；前者是降解有機物的主體，後者是活性污泥中食物鏈的重要組成，對改善出水質量有著重要作用，同時是系統運行狀態的生物指示劑。
3.菌種
提高生化裝置效率的關鍵是菌種。因此培育適應能力強、降解有機物速度快、易培養和馴化的高活性專性菌是本工藝的核心技術。該技術耗費了研發人員巨大的精力。
（1）特殊的誘變選育
這是培育菌種的第一步，也是至關重要的一步。我們從運行二十多年的裝置（廢水成份：硝基苯、苯胺、氨基酚、硝基氯苯、硝基酚鈉等）中取得初始菌種，採用現代生物技術，歷經5年時間，通過無數次誘變處理、選育、馴化，選育出了一組專性菌株----假單胞菌FD126。
FD126是通過誘變產生的新種，在原處理裝置中根本找不到這種假單胞菌；由於菌種誘變率較低，一般在10-6—10-8，誘變因子的選擇、誘變劑的配合等諸多因素造成突變新種的偶然產生。在Stamer書中對種類的描述中不能找到該種的具體分類。
（2）明顯的去除效果
硝基酚類、硝基苯、苯胺類等都是難生物降解的有機氮化合物,進水中該類有機氮化合物濃度通常要求在5-10 mg/L以下，採用假單胞菌FD126處理含苯系列衍生物廢水，其進水濃度可大幅度提高到500-800mg/L；通過廢水處理試驗，單一採用硝基苯、苯胺及其衍生物作假單胞菌FD126的碳源和氮源，充分接觸18 - 24小時，試驗結果是廢水中這些有機物幾乎被完全轉化為CO2、H2O和細胞物質，去除率達99.9% ,出水完全達到GB8978-1996一級排放標準。
