甘肅中醫學院圖書館成立於1978年，2000年搬入新館，館舍總面積7800平方米，有各類閱覽室10個，閱覽座位857個，下設辦公室、流通部、采編部、期刊部、展教中心、信息中心、古籍文獻室等七個部門。經過29年的不懈努力，本館已逐步形成了以中醫文獻為主、西醫文獻並重、兼容其它學科的藏書體系。
目前館藏圖書46萬冊/種，其中紙質文獻36萬冊，古籍2.7萬餘冊，內有域外刻本朝鮮內府刊《東醫寶鑑》、元刻《（聞人氏）痘疹論》、明刻本《類經》等善本，另有台灣新文豐出版公司出版的《敦煌寶藏》、文淵閣影印本《四庫全書》以及收納西北文獻的大型叢書——《中國西北文獻叢書》。
在注重紙質文獻建設的同時，近幾年大力發展電子資源建設，2001年建成並開通了中國知識基礎設施工程（CNKI）網路平台——甘肅中醫學院鏡像站點，鏡像站點的開通，極大地提高了信息情報資源在數位化、網路化條件下的使用效率, 提高了為教學、科研的服務手段。與此同時還購買了《中國生物醫學文獻資料庫》（CBMdisc），2005年增加了《中國優秀博、碩論文資料庫》醫藥衛生專輯，2006年購進5000餘種方正電子圖書，2007年又購進10萬餘種時代聖典電子圖書，隨著圖書館經費的逐年增加，本館將購買和自建更多資料庫為教學科研提供快捷、準確的信息服務。為配合教學, 圖書館特錄製了部分教學錄像帶，為學生播放。
圖書館功能齊全，對學生提供閱覽外借、網上檢索、全文下載、打字複印、磁帶錄製等各項服務，定期對學生進行電子資源利用培訓，通過參觀使新生對圖書館有了初步了解和認識。
現有正式職工26人，其中大專以上學歷18人, 占全館職工的68%；高級職稱4人，占16%；中級職稱7人，占28%。業務部門專業技術人員11人，占職工的44%。
