主要職責
（一）貫徹執行國家和省有關自由貿易試驗區建設的方針、政策、法規、規章和制度，擬訂自由貿易試驗區管理地方性法規草案、政府規章草案和規範性檔案。
（二）研究擬訂自由貿易試驗區發展規劃和計畫，組織研究片區發展重大問題。
（三）研究、推動出台自由貿易試驗區綜合改革、投資、貿易、金融、人才等政策並組織實施。
（四）具體協調國家、省、市相關部門和澳門有關自由貿易試驗區事務，深入推進珠澳服務貿易自由化。
（五）統計發布自由貿易試驗區公共信息。
（六）承擔中國（廣東）自由貿易試驗區工作辦公室交辦的工作，負責中國（廣東）自由貿易試驗區珠海橫琴新區片區工作領導小組日常工作。
（七）承辦市委、市政府交辦的其他事項。
工作機構
將原橫琴新區管理委員會11個工作機構，調整最佳化為橫琴新區管理委員會（中國〈廣東〉自由貿易試驗區珠海橫琴新區片區管理委員會）12個工作機構，正處級。
（一）辦公室。
負責辦文、辦會、督辦工作；負責機要、保密、檔案工作；負責信息、宣傳、信訪、應急工作；負責機關財務、資產管理、後勤服務工作；承擔與市人大、市政協的聯絡工作。
（二）黨群工作部。
負責黨建、組織、人事、機構編制管理等工作；負責人才引進、儲備及服務工作；負責群團、統戰、民族宗教事務等工作；負責離退休人員管理服務工作。
（三）政策法規室。
負責政策法規、體制機制創新和綜合改革研究；擬訂自由貿易試驗區管理有關地方性法規草案、政府規章草案和規範性檔案，建立健全政策法規體系；負責法制建設及行政複議工作；負責規範性檔案審核和備案工作。
（四）發展改革局。
負責擬訂區域發展戰略、經濟發展規劃及各專項規劃並組織實施；負責組織推動可持續發展、擴大開放、粵港澳合作等重大改革工作，負責區域投融資和重大項目推進；負責統計分析工作。
（五）商務局。
負責推進投資便利化和貿易自由化工作；負責外商投資審批、備案等工作；建立健全事中事後監管體系；負責產業發展、培育貿易新業態、加強公平貿易管理等工作，負責智慧財產權保護和管理工作；負責政務服務、科技創新和信息化建設工作；負責通關制度創新、協調口岸聯檢單位等工作。
（六）金融服務局。
負責推動金融創新工作；聯絡金融監管部門，落實各項金融管理制度；協調引進境內外各類金融機構和交易主體；負責深化與港澳金融機構合作，推進與港澳金融市場對接。
（七）澳門事務局。
負責組織落實粵澳、珠澳合作協定；組織實施與澳門合作相關的產業發展專項規劃和投資項目跟蹤服務，與澳門建立全面深入的溝通聯絡機制；負責對外交流合作，促進與澳門社會事務合作。
（八）財政局。
負責擬訂財稅發展規劃、政策和改革方案並組織實施；負責編制年度財政收支預決算草案，管理財政收支；負責預算外財政專戶及各項政府性基金管理；負責財稅、國有資產監管等工作。
（九）規劃國土局。
負責城市發展規劃研究；編制城市總體規劃、土地管理總體規劃、城市更新規劃等並組織實施；負責土地利用、地質礦產、測繪管理、地質災害防治、房地產管理等工作。
（十）建設環保局。
負責市政設施、園林綠化、人防工程和跨界交通基礎設施建設；負責自然生態系統和環境保護工作，推進生態文明建設；負責港口、水務、三防、農林漁業、交通運輸等工作。
（十一）社會事務局。
負責擬定社會事務發展規劃並組織實施；負責社會管理體制創新、公共服務和社會保障體系建設工作；負責教育、民政、人力資源、勞動就業、文化、體育、旅遊、衛生、計生等工作；負責社區組織、社會組織、社區公共設施的建設和監督管理工作。
（十二）綜合執法局（安全生產監督管理局）。
負責城市管理和綜合行政執法工作；負責打擊走私、司法保障、防邪教、綜合治理等工作；負責安全生產、食品藥品監督管理工作，承擔橫琴新區安全生產委員會辦公室的日常工作。
人員編制
橫琴新區管理委員會（中國〈廣東〉自由貿易試驗區珠海橫琴新區片區管理委員會）行政編制97名，行政執法專項編制43名，其中，書記1名、副書記2名（其中1名兼任主任）、紀委書記1名；主任1名、副主任4名；工作機構領導職數36名（處級正職12名，處級副職24名）。後勤服務人員數20名。
其他事項
（一）橫琴新區管理委員會（中國〈廣東〉自由貿易試驗區珠海橫琴新區片區管理委員會）辦公室內設3個處，分別為秘書處、公共關係處、後勤保障處，均為正科級建制。3個處各設處長1名（分別由辦公室副主任兼任）、副處長1名（科級副職）。
（二）原橫琴新區管理委員會綜合管理和行政執法局職責由橫琴新區管理委員會（中國〈廣東〉自由貿易試驗區珠海橫琴新區片區管理委員會）綜合執法局（安全生產監督管理局）承擔。
設立意義
中共珠海市委組織部副部長、市編辦主任郭毅說，批覆設立橫琴新區管委會其意義包括“五個有利於”：有利於和國內外戰略投資者的溝通與對話；有利於促進橫琴新區的整體開發管理水平和行政效能的提高；有利於促進珠江口西岸地區產業最佳化升級和提升整體實力、深入推進粵港澳緊密合作；有利於促進澳門經濟適度多元發展和港澳地區長期繁榮穩定；有利於珠海經濟特區的長遠發展和先行先試的探索。
機構設定
據了解，新組建的橫琴新區管委會的內設機構體現了“大部制”思路。除辦公室和黨群工作部外，橫琴新區內設統籌發展委員會、產業發展局、財金事務局、公共建設局、社會事業局、交流合作局、行政服務促進局、警務和綜合管理局等八大局，少於市、區內設機構。
建設信息
橫琴新區先期啟動的項目建設正在開展。長隆海洋樂園展示廳已完成主體建設，目前正在進行內部裝修和室外綠化工程。澳門大學用地也正在緊張進行土地平整、澆築水泥。十字門商務區首個展覽廳已完成主體和玻璃外牆工作。
據了解，珠海橫琴是繼上海浦東新區、天津濱海新區之後，第三個由國務院批准的國家級新區，按其發展規劃，將主要有三大定位（“一國兩制”下探索粵港澳合作新模式的示範區、深化改革開放和科技創新的先行區、促進珠江口西岸地區產業升級的新平台）等。到2015年，人口規模為12萬人，人均GDP為12萬元人民幣；到2020年，人口規模為28萬人，人均GDP為20萬元人民幣。
