家世
史書第一次提到他是679年，當時他在尚書省任左司郎中。他仗著唐高宗恩寵，多行不法，欺壓同僚，遭到侍御史狄仁傑彈劾，（材料見 《為法理直諫逆龍鱗 引盜者自首達權宜》）高宗本想放過他，但狄仁傑堅持己見，指出唐朝並不缺少和王本立一樣才幹的人。高宗讓步了，同意處罰王立本。683年，東突厥可汗骨咄祿襲擊鄰近的單于總督府，俘殺司馬張行師。此時王本立任勝州都督，高宗命他和夏州都督李崇義一同防禦東突厥進攻，但史書沒有記載下文如何。
唐睿宗年間
就在683年，唐高宗駕崩，太子李哲繼位為唐中宗，但武皇后（即後來的武則天）以太后攝政，掌握實權。684年春，中宗表現出獨立執政的跡象，被武后廢黜，改立其弟豫王李旦為帝，即唐睿宗，她本人愈發掌控實權。687年，武后信任的謀士劉禕之被彈劾收受契丹首領孫萬榮賄賂及與已故宰相許敬宗妾通姦。史書則暗示劉禕之被彈劾是因為武后收到舉報稱他希望她還政睿宗，被武后視為叛徒。武后命時任肅州刺史的王立本調查此事。當王本立到劉禕之府上宣讀武后的敕令時，劉禕之說：“沒有經過鳳閣鸞台簽署的怎么能叫敕令？”王本立回報武后，武后大怒，賜劉禕之自盡。
688年，王本立任夏官侍郎，授同鳳閣鸞台平章事，為實質宰相。次年，他的宰相銜又被升為同鳳閣鸞台三品。當他在690年春罷相改任地官尚書時，被稱作“宰相、左肅政大夫”。僅1個月後，他就死了——《資治通鑑》沒有記載他的死因，但《新唐書本紀第四 則天皇后》稱他是被處決的。
注釋及參考文獻
《新唐書》卷七十二·表第十二 宰相世系二
《新唐書》卷四
《資治通鑑》卷二百零二、卷二百零三、卷二百零四
