個人經歷
在球迷父親的影響下，10歲開始踢球。1958年進虹口區少體校習練足球，1959年進市青少體校接受正規訓練，1961年入選上海市隊，1965年入選國家足球隊，70年代初任國家隊隊長。主要踢邊鋒，身體素質好，技術全面，尤以快速靈巧見長，在比賽中常以漂亮的個人突破、準確的底線傳中和凌歷的射門功夫博得球迷青睞，被稱為“飛將軍”。
晚年的王后軍身體一直不太好，大多數時間留在家中調養身體，不過儘管如此，他還是非常關心上海的青少年足球發展，另外王后軍也經常在上海本地的報刊上發表文章，表達自己對於上海足球發展的一些看法。
2012年開始，王后軍指導的身體健康情況不斷惡化，被缺診為尿毒症，出行也只能坐在輪椅上，從5月份開始，每周還必須做三次血液透析，身心和經濟上都承受了巨大的壓力，為了幫助他渡過難關，包括劉軍、毛毅軍、朱炯等一桿昔日弟子還專門為他舉行募捐活動，並設立“劉軍足球慈善基金”，幫助上海足壇一些需要幫扶的老同志。
2012年11月21日19點35分，中國足壇名宿、前上海隊主教練王后軍因病醫治無效，在上海市第十人民醫院去世，享年69歲 。
職業生涯
王后軍與徐根寶王后軍從虹口少體校、市少體校進入上海隊，1965年入選中國國家隊，1970年代初期曾經成為國家隊隊長，主要踢邊鋒，身體素質好，技術全面，尤以快速靈巧見長，在比賽中常以漂亮的個人突破、準確的底線傳中和凌歷的射門功夫博得球迷青睞，被稱為“飛將軍”。1975年掛靴後任上海隊教練，曾協助方紉秋率上海隊由1981年的乙級隊打回甲級隊，並在1983年奪得全運會冠軍。1984年升任上海隊主教練，率隊在第一屆、第二屆足協杯賽中獲第三名，此後一直率上海隊位列全國甲級聯賽的前列。1993年上海申花俱樂部成立，徐根寶成為了俱樂部的首任主教練，王后軍後來執教上海浦東隊，並率隊殺甲B聯賽，但是次年聯賽中因為健康原因離任。在上海足壇，他素有“小諸葛”之稱。
1993年12月，上海成立了中國第一家完全脫離政府體育系統的職業足球俱樂部上海申花。但是已經擔任了近十年上海隊主教練的王后軍卻出人意料的沒有被選聘為申花主帥，而是由另一位長期在外地執教的上海人徐根寶擔任。1995年，新成立的上海浦東足球俱樂部邀請王后軍擔任總教練，他率隊奪得了乙級聯賽的冠軍殺入甲B聯賽，但是次年聯賽過程中由於健康原因離任。
