濟南市食品藥品檢驗檢測中心（以下簡稱中心）隸屬於濟南市食品藥品監督管理局，正處級全額拔款事業單位，是綜合性食品藥品法定檢驗檢測機構，法定職責是：承擔轄區內食品、藥品、保健食品、化妝品的相關檢驗檢測工作；負責全市藥品和化妝品不良反應、醫療器械不良事件及藥物濫用調查表的收集、核實、評價、反饋、上報工作；承擔藥品相關產品註冊技術審評工作；承擔藥品生產經營企業相關認證及諮詢服務等工作。1991年獲得市級文明單位榮譽稱號，2008年獲得省級文明單位榮譽稱號。2010年1月通過中國合格評定國家認可委員會實驗室認可；2009年、2011年、2013年獲得山東省食品藥品監督管理局藥品不良反應監測先進集體、醫療器械不良事件監測先進集體、藥物濫用監測先進集體等榮譽稱號，2013年獲全國藥械不良反應/事件監測先進集體榮譽稱號。
中心始建於1949年2月，前身是濟南市衛生實驗所，1973年3月正式更名為濟南市藥品檢驗所（編制80人），承擔全市藥品檢驗任務，1999年11月整建制由濟南市衛生局劃歸濟南市食品藥品監督管理局，2011年9月增加餐飲環節食品檢驗、保健食品檢驗、化妝品檢驗和藥品不良反應監測、醫療器械不良事件監測等職能，更名為濟南市食品藥品檢驗所，加掛濟南市藥品不良反應和醫療器械不良事件監測中心牌子（編制100人）。2013年12月，增加了生產環節食品檢驗和流通環節食品檢驗職能，更名為濟南市食品藥品檢驗檢測中心（濟南市藥品不良反應和醫療器械不良事件監測中心）（編制112人），原濟南市質量技術監督管理局食品質量監督檢驗中心整建制劃入濟南市食品藥品檢驗檢測中心。
中心編制為112名，現有幹部職148人，其中在編人員99人，契約制人員49人。管理人員30、專業技術人員110人。各級各類專業技術人員中正高級職稱4人，副高級18人，中級及相當於中級職稱的專業技術人員66人。本科及以上學歷人員136人，其中碩士研究生人48人，博士研究生2人。
中心現內設機構13個，包括綜合科、組織人事科、財務科、業務管理科、檢測物資供應科、食品檢驗所、化學藥檢驗科、中藥檢驗科、抗生素檢驗科、保健食品和化妝品檢驗科、藥理檢驗科、藥品不良反應和醫療器械不良事件監測科、審評認證科（濟南市藥品審評認證中心）。其中，食品檢驗所是在原濟南市質量技術監督管理局食品質量監督檢驗中心基礎上建立的，是濟南市食品藥品檢驗檢測中心下設的非法人實驗室，負責對外開展食品、保健食品、食品添加劑等檢驗檢測業務；審評認證科（濟南市審評認證中心）是在市局審批辦的組織領導下，獨立承擔審評認證材料的技術審評、組織現場核查、驗收、認證等工作。
中心現有實驗室總面積約18000平方米，其中高新區濟南藥谷實驗室面積16000平方米，英雄山路實驗室面積2000平方米。擁有液質聯用儀、氣質聯用儀、高效液相色譜儀、胺基酸分析儀、電感耦合電漿質譜儀、離子色譜儀、全自動病源微生物檢測系統、原子吸收分光光度計、紅外分光光度計、全自動溶出儀等主要儀器設備近400多台（套），設備總價值5000多萬元。中藥標本室面積120平米，現有中藥標本2000多個。動物房使用面積800餘平米，其中普通環境245平米，屏障環境165平米，輔助實驗區230平米，辦公區176平米。具有普通環境兔、豚鼠和屏障環境小鼠、大鼠的實驗動物使用許可證書。擁有各類檢驗資質21756個參數，其中藥品檢驗參數165個，食品21103個參數（595個產品全檢參數11249個、436個產品的部分參數8253個、525個方法參數1601個），保健食品154個參數，化妝品326個參數，潔淨室環境8個參數。基本能依法開展食品、保健食品、藥品、化妝品檢驗檢測業務。
2010年，在濟南市政府、山東省食藥監管局、濟南市食藥監管局等多方財政支持下，中心於濟南市高新區購置了新檢驗大樓，為濟南出口加工區國家創新藥物孵化器建設項目4號樓，該樓地下一層，地上十層，實驗室面積約16000平方米，投資10510萬元。該實驗樓已正式使用，全面開展檢驗檢測工作，一個資源配置合理、運行體系完善、檢驗機制科學、檢測能力突出的副省級食品藥品檢驗檢測機構已中國濟南藥谷誕生。新實驗大樓的啟用，標誌著濟南市食品藥品檢驗檢測事業又邁上了一個新的台階。
