人物成就
先後承擔和完成了國家863計畫、國家重大新藥創製專項、國家科技支撐計畫重點項目及國家自然基金項目等二十幾項科研課題。近年來,在《Cell》、《PLoS Genetics》、《Laser Physics Letters》、《Nucleic Acids Research》、《Molecular Microbiology》、《Applied and Environmental Microbiology》和《Journal of Bacteriology》等SCI刊物上發表研究論文30餘篇,授權專利5項,申請PCT專利2項。
研究領域
在套用基礎研究方面,利用分子生物學技術,建立高效、靈敏、簡便、快速、用途廣的微生物遺傳作業系統;根據代謝工程原理,採用基因敲除,過表達等方法進行分子育種;通過比較基因組學和比較蛋白質組學等方法研究胺基酸、核苷等的代謝調控機制;利用生物信息學軟體進行途徑分析,構建基因組規模網路的代謝模型,探討代謝途徑中基因突變與代謝流的相對應關係,解析胺基酸和核苷生物合成途徑中關鍵酶的結構,研究酶的催化機制,根據結構生物學原理進行蛋白質分子定向改造,提高酶的催化活性並解除反饋抑制調節。在套用研究方面,主要進行芽孢桿菌、棒桿菌、大腸桿菌等的胞內代謝網路,包括胺基酸、核苷、胞外酶等代謝產物的代謝、調控、吸收轉運,以及細胞整體對不同發酵條件的應答等方面的研究;同時,利用分子生物學和代謝工程技術,對胺基酸及其衍生物合成代謝網路進行重構和調控,進行胺基酸及其衍生物基因工程菌的選育,通過精細代謝調節進行胺基酸及其衍生物發酵過程控制及工業化生產等方面的套用研究。
研究內容
1、 高效、簡便、靈敏、快速、用途廣的微生物遺傳作業系統的建立和套用
2、 產蛋白酶、澱粉酶等工業生產菌的改造和分子系統生物學研究
3、 具有優良特性的工業酶的篩選、分子定向進化和結構解析
4、 趨磁細菌中與磁鐵礦形成相關的蛋白的結構解析和功能分析
5、 蘇氨酸、蛋氨酸、絲氨酸、組氨酸和色氨酸等L-型胺基酸的系統代謝工程和發酵過程控制研究
6、 高附加值胺基酸衍生物D-苯丙氨酸、羥脯氨酸、d-脯氨酸、2-氨基丁酸、戊二胺及尼龍54的生物合成研究
承擔課題
國家863計畫項目“L-蘇氨酸工程菌的構建及發酵條件最佳化”和“熱穩定低溫鹼性蛋白酶的定向改造”;“十一五”國家科技支撐計畫重點項目“L-組氨酸和L-色氨酸的微生物發酵及分離純化技術”;國家重大新藥創製專項課題“微生物發酵生產核苷和胺基酸技術平台與產品研發和產業化孵化”;中國科學院知識創新工程重要方向項目“鹼性蛋白酶高產菌種定向改造與發酵條件最佳化”等。
學術兼職
天津科技大學兼職教授,博士生導師;中國科技大學兼職教授,博士生導師;
現為《Applied and Environmental Microbiology》和《微生物學報》編委。
人物經歷
1989年8月~2004年1月在天津中醫藥大學(第一附屬醫院)分子生物學實驗室工作,擔任國家中醫藥管理局分子生物學三級實驗室主任,2001年9月晉升為正高職稱。2004年1月到法國國家科研中心(CNRS)UPR9073從事博士後研究工作,2005年11月被中國科學院微生物研究所引進回國,被聘為研究員,博士生導師,研究組組長(PI),並擔任中國科技大學和天津科技大學兼職教授,博士生導師; 現為《Applied and Environmental Microbiology》和《微生物學報》編委。主要研究領域為微生物的代謝工程與系統生物學研究以及微生物遺傳作業系統的構建、改造和利用。
學習經歷
1982.9-1986.7 南開大學生物系 學士
1986.9-1989.7 南開大學生物系 碩士
1999.8-2002.7 南開大學生命科學院 博士
工作經歷
1989.8-2004.1 天津中醫藥大學(第一附屬醫院)
2004.1-2005.9 法國國家科研中心(CNRS) UPR9073 博士後研究員
2005.11- 中科院微生物研究所研究員,博士生導師,研究組組長
學術成就
近五年發表的代表性SCI論文(通訊作者)
1.Aihua Deng, Guoqiang Zhang, Nana Shi, Jie Wu,Fuping Lu, Tingyi Wen*. Secretory expression, functional characterization and molecular genetic analysis of a novel halo-solvent-tolerant protease fromBacillus gibsonii. Journal of Microbiology and Biotechnology. 2014; 24(2): 197-208.
2.Xiuling Shang, Yun Zhang, Guoqiang Zhang, Xin Chai, Aihua Deng, YongLiang, Tingyi Wen*.Characterization and Molecular Mechanism of AroP as an Aromatic Amino Acid and Histidine Transporter in Corynebacterium glutamicum. Journal of Bacteriology. 2013, 195(23):5334-5342.
3.Shuwen Liu, Yong Liang , Qian Liu, Tongtong Tao, Shujuan Lai, Ning Chen, Tingyi Wen*. Development of a two-stage feeding strategy based on the kind and level of feeding nutrients for improving fed-batch production of L-threonine by Escherichia coli. Applied Microbiology and Biotechnology. 2013, 97(2):573–583.
4.Guoqiang Zhang, Wenzhao Wang, Aihua Deng, Zhaopeng Sun, Yun Zhang1, Yong Liang, Yongsheng Che, Tingyi Wen* .A Mimicking-of-DNA-methylation-patterns Pipeline for Overcoming the Restriction Barrier of Bacteria. Plos Genetics .2012, 8(9): e1002987.
5.Yun Zhang, Xiuling Shang, Shujuan Lai, Guoqiang Zhang, Yong Liang, Tingyi Wen*. Development and application of an arabinose-inducible expression system by facilitating inducer uptake in Corynebacterium glutamicum. Applied and Environmental Microbiology. 2012, 78(16):5831-5838.
6.Aihua Deng, Zhaopeng. Sun, Guoqiang. Zhang, Jie Wu, Tingyi Wen*. Rapid discrimination of newly isolated Bacillales with industrial applications using Raman spectroscopy. Laser Physics Letters. 2012, 9(9), 636–642.
7.LAI ShuJuan, ZHANG Yun, LIU ShuWen, LIANG Yong, SHANG XiuLing, CHAI Xin, WEN TingYi*. Metabolic engineering and flux analysis of Corynebacterium glutamicum for L-serine production. SCIENCECHINALife Sciences. 2012, 55(4): 283–290(Cover Article).
8.Yun Zhang, Xiuling Shang, Aihua Deng, Xin Chai, Shujuan Lai, Guoqiang Zhang, Tingyi Wen*. Genetic and biochemical characterization of Corynebacterium glutamicum ATP phosphoribosyltransferase and its three mutants resistant to feedback inhibition by histidine. Biochimie. 2012, 94(3):829-838.
9.Guoqiang Zhang, Aihua Deng, Qingyang Xu, Yong Liang, Ning Chen*, Tingyi Wen*. Complete genome sequence of Bacillus amyloliquefaciens TA208, a strain for industrial production of guanosine and ribavirin, Journal of Bacteriology. 2011, 193(12):3142-3143. Q2
10.Haojian Li,Guoqiang Zhang,Aihua Deng,Ning Chen, Tingyi Wen*. De novo engineering and metabolic flux analysis of Bacillus subtilis for inosine biosynthesis. Biotechnology letters. 2011, 33(8):1575–1580.
11.Aihua Deng, Jie Wu, Guoqiang Zhang, Tingyi Wen* .Molecular and structural characterization of a surfactant-stable high-alkaline protease AprB with a novel structural feature unique to subtilisin family . Biochimie. 2011, 93(4):783-791.
12.Guoqiang Zhang, Peng Bao, Yun Zhang, Aihua Deng, Ning Chen, Tingyi Wen*.Enhancing electro-transformation competency of recalcitrant Bacillus amyloliquefaciens by combining cell-wall weakening and cell-membrane fluidity disturbing. Analytical Biochemistry. 2011, 409(1):130–137. Q3
13.Aihua Deng, Jie Wu, Yun Zhang, Guoqiang Zhang, Tingyi Wen*. Purification and characterization of a surfactant-stable high-alkaline protease from Bacillus sp. B001. Bioresource Technology. 2010, 101(18): 7100-7106.
14.Ning Chen, Jin Huang, Zhibin Feng, Lei Yu, Qingyang Xu, Tingyi Wen*. Optimization of fermentation conditions for the biosynthesis of L-threonine by Escherichia coli. Applied Biochemistry and Biotechnology. 2009, 158(3): 595-604.