該所按機構編制規定,設有柑橘、時鮮水果、園林花卉、設施園藝、園藝資源等五個專業研究科室和辦公室、科技管理科、基地管理科、財務資產科、黨務人事科等五個行政科室,內設保衛科和科技示範場。
為促進科技成果的有效轉化,該所成立了高新技術企業—湖南格瑞園藝科技發展有限公司,註冊資金1680萬元,擁有國家貳級園藝園林設計、施工資質。
該所建立了廣泛的國際合作關係,與紐西蘭、法國、智利、義大利、美國、日本、澳大利亞等國在柑桔、獼猴桃、時鮮水果、花卉等領域有長期密切的交流與合作,先後授權法國、紐西蘭、智利等國的國際知名企業分別在歐洲、亞洲和美洲推廣該所的果樹新品種。該所先後承擔並完成了農業部“中國—澳大利亞柑橘發展項目”和“中國—歐共體果蔬加工試驗示範項目”等國際合作項目。
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