生態型清潔小流域主要位於水庫、河道周邊的水源保護區、生態敏感區、旅遊景點和村鎮等區域，以小流域為單元，在傳統水土保持工作開展的基礎上，引進小型污水處理設施建設、垃圾填埋設施建設、濕地建設與保護、生態村建設、限制農藥化肥的施用、退稻三禁、庫濱區水土保持生態緩衝帶建設等措施，大大改善了生態，有效保護了水源，營造了優美的人居環境，提高了百姓的生產生活質量。
